R - 从矩阵创建网络

Question

我有一个类似的数据集：

Abruzzo<- c(1,0.76,0.8,0.90)
Campania<- c(0.76,1,0.62,0.69)
Calabria <- c(0.80,0.62,1,0.85)
Puglia <- c(0.90,0.69,0.85,1)
X <-data.frame(Abruzzo,Campania,Calabria,Puglia)
row.names(X)<- c ('Abruzzo','Campania', 'Calabria', 'Puglia')

该矩阵包含余弦相似度值。 我想创建一个网络（带有 igraph），其中 4 个节点（Abruzzo、Campania、Calabria、Puglia）都是互连的，并且链接的大小取决于矩阵的相应值。 谢谢

Answer 1

你有一个加权邻接矩阵。 使用igraph::graph_from_adjacency_matrix ：

library(igraph)
X <- as.matrix(X)
diag(X) <- 0
g <- graph_from_adjacency_matrix(X, mode = "lower", weighted = "weight")
plot(g, edge.width = E(g)$weight, edge.label = E(g)$weight)

如果您想要有向图，请将模式更改为"directed" 。