“警告：临时文件中的错误：在渲染多个 R 降价时找不到未使用的临时文件名”

Question

我有一个过程，它使用rmarkdown::render(template_file, output_file)将多个 R markdown 文档顺序呈现并保存到一个目录中。

我发现当进程超过 100 个渲染文档时，它会停止并显示以下消息：

Warning: Error in tempfile: cannot find unused tempfile name

我怀疑 knit/pandoc 过程中存在与导致此问题的中间文件相关的某些问题，但想知道是否有其他人以前遇到过这样的问题？

Answer 1

我在使用rpy2时遇到了这个问题，一次又一次地循环 R 代码中继。 它仅在一定数量的循环后发生。 首先删除临时文件或减少使用的临时文件的数量应该可以解决问题。

但是，我的代码使用难以跨平台更改的 3rd 方包。 所以我只是删除所有临时文件。

我通过将其添加到我的代码中解决了这个问题：

sapply(file.path(tempdir(), list.files(tempdir())), unlink)

然后我重新启动一些可能使用我删除的临时文件的代码。

希望这能解决您的问题。