虚拟环境中的 Conda ModuleNotFoundError

Question

显然有很多类似的问题，但我不得不再次问同样的问题，因为我无法从其他问题（也没有其他任何合理搜索的地方）中找到解决方案（有效）。

另请注意，我刚刚开始使用 Python。
我也觉得有必要解释我目前拥有的一切。 所以......抱歉这篇长帖子

主要问题

我有一个旧的 Python 项目，我需要在本地工作（在 Ubuntu 20.04 上）。 这个项目有 environment.yml 和 requirements.txt 文件。

创建一个虚拟环境：

conda env create -f environment.yml

这将创建虚拟环境，我可以激活它并看到它安装了“烧瓶”。

conda list |grep flask
>> flask                     1.1.2                    pypi_0    pypi

pip list |grep Flask
>> flask                     1.1.2                    pypi_0    pypi

但是当我尝试运行该应用程序时，出现错误：

ModuleNotFoundError: No module named 'flask'

'flask' 的版本一开始实际上是 conda 的 1.1.2 和 pip 的 1.1.1，但我在某些时候将它们更改为相同的（尽管出现相同的错误，也尝试了其他几个版本）。

主要问题：我在做什么/做错了什么？

我所拥有的和我尝试过的

创建环境后，我尝试通过requirements.txt进行pip安装。 我在虚拟环境内外都这样做了。

pip install -r requirements.txt

但是由于找不到库，这会导致很多错误，所以我认为它可能已经过时（或者只是不适用于我当前的环境）。 我知道它应该代表为应用程序工作的环境安装的库。 （我的猜测是这最初是从运行应用程序的容器中获取的？）

我确实找到了一个有效的解决方案。 我用 apt 手动安装了烧瓶（以及之后的其他几个库）：

sudo apt install python3-flask

然而，这显然不是正确的解决方案，因为库应该只在虚拟环境中（afaik）。 此外，这似乎与 pip 一起工作过一次（也许与 anaconda 一起......不再知道了。不能让它再次发生。）。 我想我可以手动将这些要求写入一个新的“requirments_local.txt”并使用它，如果我可以再次使用 pip install 工作，但我认为这是错误的（为什么要有 environment.yml 和一个需求文件？） . （environment.yml 也有pip库要安装）

我不认为这很重要，但写下来以防万一。
该应用程序通过两个 bash 脚本启动，其中第一个脚本设置了一些运行时设置，然后调用另一个脚本（容器也使用的 entrypoint.sh），该脚本最终具有以下行来启动实际应用程序：

exec gunicorn -b 0.0.0.0:5000 myapp:app

（似乎没问题，因为应用程序在 docker 容器中启动，甚至在本地启动时？全局？安装依赖项）在调用第二个脚本之前激活虚拟环境，通过在脚本中包含以下行：

source activate $env_name

我正在使用源代码，因为我注意到 'conda activate $env_name' 不起作用。 我通过在两个脚本的不同阶段执行“conda env list > conda.txt”来检查是否正在使用正确的环境。

我使用 Ubuntu 20.04 并安装了这些：

• Python 2.7.18 (Python)
• Python 3.8.10 (Python3)
• 来自 /usr/lib/python3/dist-packages/pip (python 3.8) 的 pip 20.0.2
  • pip3 给出相同的
• conda 4.10.3（通过安装 miniconda）

我一直在使用蟒蛇代替miniconda因为似乎是在requirements.txt指向森蚺一些依赖也试过，但与瓶的错误是一样的。

其他问题：我可以从版本控制中省略requirements.txt还是可以以某种方式与environment.yml集成？ 将库版本列在两个文件中感觉不对。 在已经创建虚拟环境时，要求的目的是什么？

Answer 1

尽管@razimbres 的建议实际上并不正确，但它让我思考了为什么在虚拟环境中找不到库的原因。 （是否有什么东西可以指导应用程序在 env 之外寻找库）

我已经通过apt安装了绿色独角兽，因为它的缺失是最初启动应用程序时的第一个错误。

exec gunicorn -b 0.0.0.0:5000 myapp:app

./entrypoint.sh: line 62: exec: gunicorn: not found

由于它从environment.yml中丢失并且不知道更好，我通过apt安装了它（因为它在那里......尽管现在有人可以解释为什么？它显然只是把事情搞砸了。）。

我在environment.yml 中添加了以下（conda）依赖项：
- 枪炮==20.1.0

然后再次创建环境：

conda env remove --name $env_name
conda env create -f environment.yml

现在它起作用了。 （甚至从脚本开始）
我认为教训是：不要使用 apt 来安装任何 python 资源。

还。 如果有，请卸载通过 apt 安装的所有 python 资源。 就像我的情况：

sudo apt remove gunicorn

附言。 似乎也不需要requirements.txt 。 也许它可以被删除（稍后）。 感觉它现在只是引起混乱。