[英]Increasing array index in openMP
我刚开始使用 OpenMP。 我正在尝试并行化一个嵌套循环,到目前为止我有这种形式的东西......
#pragma omp parallel for
for (j=0;j <m; j++) {
some work;
for (i= 0; i < n ; i++) {
p =b[i];
if (P< 0 && k < m) {
a[k] = c[i]; k++ ;
} else {
x=c[i];
}
}
some work
}
外循环是并行的,内循环更新k
。 其他线程需要k
的当前值才能正确更新a[k]
。 问题是所有线程都在更新a[k]
,但是 k 的正确顺序没有保持。
有些线程会更新k
和a[k]
,有些则不会。 我如何在线程之间传递最新的k
以正确更新a[k]
,因为c[i]
对每个线程都有不同的值?
例如,当它串行运行时,程序可能会将a
的前七个值设置为{1,3,5,7,3,9,13}
并以k
等于 7 终止,但是当并行运行时,会产生不同的结果,或导致不同的(因此是错误的)顺序。
如何保持相同的顺序并同时确保并行性?
注意:根据 OP 的说明,此答案已完全重写。 原答案在文末。
如何保持相同的顺序并同时确保并行性?
顺序依赖与并行是对立的,因为并行运行操作本质上需要放宽执行它们的相对顺序。 并非所有计算都可以有效地并行化。
你的情况也不例外。 外循环的第二次和每次后续迭代需要使用上一次迭代计算的k
的最终值(除其他外)。 它怎么能得到那个? 只有先执行前一次迭代。 这为并发操作留下了什么空间? 没有任何。 并发性与并行性不同,但它是并行性的主要动机之一,因为这就是并行性在运行时间上产生改进的方式。
由于没有 scope 用于并发,并行性对您来说会适得其反。 假设您将外部循环的整个主体设为关键部分,因此实际上没有并发性(正如您当前的代码所要求的那样)并且没有涉及k
的数据竞争。 那么你仍然会为并行性付出开销,得不到加速作为回报,并且可能仍然会因为以错误的顺序执行外循环体的评估而得到错误的结果。
可能整个事情都可以重写以减少或删除阻止计算有效并行化的数据依赖性,也可能不会。 我们没有足够的信息来确定,因为它部分取决于“ some work
”的细节和数据的重要性。 可能您需要一种完全不同的算法来产生所需的结果。
连续整数之和有一个封闭式方程,当列表中的第一个 integer 为 0 或 1 时,它具有特别简单的形式。特别地,从 0 到n
的整数之和为n * (n + 1) / 2
。 你不需要为此减少。
如果您无论如何都想使用缩减,那么您需要了解它并不像您认为的那样工作。 您得到的是每个执行并行构造的线程的缩减变量的单独私有副本,这些独立变量的每个线程(而不是每次迭代)最终值根据缩减运算符组合。 因此,如果您真的想通过 OpenMP 归约来进行计算,那么您需要像这样重构循环:
#pragma omp parallel for reduction (+:k) for (i = 0; i < 10; i++) { a[i] = i; k += i; }
这假设k
的值在循环之前立即为 0,正如您确实在做的那样。 如果那不是一个安全的假设,那么您将需要类似
type_of_k k0 = k; k = 0; #pragma omp parallel for reduction (+:k) for (i = 0; i < 10; i++) { a[k0 + i] = i; k += k0 + i; }
请注意,在任何一种情况下,这不仅正确地设置了缩减,而且还打破了先前由表达式k++
携带的循环迭代之间的数据依赖性。
听起来您实际上是在使用来自c
的条目过滤器来填充a
,并希望保留它们的顺序。 如果这是k
的唯一用途,请记住其他一些方法 spring:
总是写a[i]
,但使用一个标记来指示不满足 P 谓词的未使用值。 这保留了顺序,但需要更大a
您可以在第二遍中进行压缩。
写一个a_i
数组存储每个条目属于哪个索引。 这仍然需要#pragma omp atomic
k_local = k++
访问k
,并进行第二次排序以恢复顺序。 而且您需要a
和a_i
再次成为完整大小,否则您可能会错过条目,因此这是一个糟糕的解决方法。
即使有一些顺序依赖关系,您也可以进行优化,例如scan
计算每个i
的k
可以在 O(log n) 而不是 O(n) 中完成。 例如并行前缀和, 关于堆栈溢出的 openmp 讨论。 我相信,这种事情就是 OpenMP 的ordered depend
。 无论如何,这导致了第三种解决方案:
k
数组,保存k
每次迭代将具有的值,以便那些将写入的线程写入正确的位置。 这需要扫描谓词。在规划算法时,拥有更高级别的构造(如 map、扫描和减少)很有用。
声明:本站的技术帖子网页,遵循CC BY-SA 4.0协议,如果您需要转载,请注明本站网址或者原文地址。任何问题请咨询:yoyou2525@163.com.