NII 文件体素数据排序

Question

我有一个包含以下元数据的.nii文件

NII Header Size:               348
NII Magic Number:              n+1
Dimension Information:
       Frequency Dimension:    0
       Phase Dimension:        0
       Slice Dimension:        0
Number of Image Dimensions:    3
        Spatial Dimension X has length:         91
        Spatial Dimension Y has length:         109
        Spatial Dimension Z has length:         91
Intent Code:                   0
Data Type:                     FLOAT
Number of bits per Voxel:      32
Description:                   6.0.5:9e026117
Voxel Dimensions:
        Voxel Dimension X has length:         2.000000
        Voxel Dimension Y has length:         2.000000
        Voxel Dimension Z has length:         2.000000
Image data begins at byte:     352
Data Scaling:
        Slope:                 1.000000
        Y-Intercept:           0.000000
Color Range:
        Min:                   0.020708
        Max:                   9.358182
Slicing Information:
        Slice Start:            0
        Slice End:              0
        Slice Duration:         0.000000
        Slice Code:             0
Measurement Units:
       Spatial Dimension:      MILLIMETER
       Temporal Dimension:     SECOND
Auxiliary File:                render1t
Q Form Code:                   4
       b:                      0.000000
       c:                      1.000000
       d:                      0.000000
       x offset:               90.000000
       y offset:               -126.000000
       z offset:               -72.000000
S Form Code:                   4
Affine Matrix:
-2.000000      0.000000      0.000000      90.000000
0.000000      2.000000      0.000000      -126.000000
0.000000      0.000000      2.000000      -72.000000
0.000000      0.000000      0.000000      1.000000
Total number of voxels:        902629

我怎么知道如何读取图像数据？ 我知道它是一个浮点数组，但是对于该数组中的每个索引，如何将其转换为ijk体素坐标？ 我真的在寻找将 .nii 文件中的每个浮点索引转换为适当的ijk体素坐标的正确函数。

我一直在看这个： https://brainder.org/2012/09/23/the-nifti-file-format/ ，但要么从未提及，要么我不明白。

Answer 1

来自 AM Winkler 在您链接的页面上的评论：

存储是RAS，即要填充的第一个维度（即运行速度更快），是“x”，从左到右，然后是“y”，从后到前，然后是“z”，从下到上. 当然，这些方向可能与实际的大脑方向不对应（如果这完全是大脑），但是一旦读取，您可以使用标题中的 3 种方向方法之一调整方向，如上所述。