在给定文件夹中编织每个 RMarkdown 文件

Question

我有一个包含几个 R Markdown (.Rmd) 文件的文件夹。 有没有办法按顺序自动编织每个文件？

目前我必须打开一个文件，单击 Knit（需要几分钟才能运行），关闭，重复下一个文件...

谢谢！

Answer 1

您可以在循环中使用rmarkdown::render function 来执行此操作。 在这里，我使用了{purrr} package 中的map()而不是显式的 for 循环。

现在假设我在目录multiple_rmd中有两个 rmd 文件

+---multiple_rmd
|       rmarkdown_file_01.Rmd
|       rmarkdown_file_02.Rmd

现在要循环渲染它们，收集文件路径（这里我使用了返回相对文件路径的list.files function）并传递这些 rmd 文件的文件路径来render function。

rmd_files <- list.files(path = "multiple_rmd/", full.names = TRUE)
rmd_files

# [1] "multiple_rmd/rmarkdown_file_01.Rmd"
# [2] "multiple_rmd/rmarkdown_file_02.Rmd"

purrr::map(.x = rmd_files, 
           .f = ~rmarkdown::render(.x, output_dir = "multiple_rmd/"))

现在渲染的 output 文件将在multiple_rmd目录中找到。

Answer 2

你可以做

purrr::map(list.files(pattern = "\\.Rmd$"), ~rmarkdown::render(.x))