用不同的 colors 绘制“标记组”

Question

我对 igraph 很陌生，并且一直在策划我的一个项目。 在我的 python 代码中，我使用了：

igraph.VertexClustering.FromAttribute(graph, attribute)

来识别组。

问题是这个 VertexCluster 的着色。 当使用 VertexCluster 作为视觉样式的“mark_groups”时，组是灰色的。 尽管使用了“mark_col”，但它并没有改变。 灰色标记组的示例

使用 VertexClustering.FromAttribute 时，如何更改 mark_groups 的 colors？

Answer 1

因为我不知道确切的代码，所以我不知道出了什么问题。 我刚刚根据这个描述创建了一个工作示例

import igraph as ig
import matplotlib.pyplot as plt

g = ig.Graph(edges=[(0, 1), (1, 2), (3, 4), (4, 5)])
g.vs["cluster"] = [0, 0, 0, 1, 1, 1]
g.vs["color"] = ["red", "blue", "blue", "green", "orange", "gold"]

communities = ig.VertexClustering.FromAttribute(g, "cluster")

num_communities = len(communities)
palette = ig.RainbowPalette(n=num_communities)
for i, community in enumerate(communities):
    g.vs[community]["color"] = i   # Remove this to keep the original colors
    community_edges = g.es.select(_within=community)
    community_edges["color"] = i

fig, ax = plt.subplots()
ig.plot(
    communities,
    target=ax,
    mark_groups=True,
    palette=palette
)

fig.savefig("clusters.png")

我尝试删除 for 循环中的第一行以保留原始 colors，但并非所有 colors 都保留在g.vs["color"] =...行中定义。 我不知道原因。 我懂了：