无法从 GitHub 上的 R package 安装 vi.nette

Question

我编码了一个 R package 托管在我的 GitHub 上。我包含了一个 vi.nette，我可以安装 package 并加载 vi.nette，而不会从 R 和 RStudio 执行以下操作：

devtools::install_github("rosalieb/serac", build_vignettes = TRUE)
library(serac)
vignette("serac")

但是，我有一些无法安装 vi.nette 的同事（他们可以下载 package 的唯一方法是执行devtools::install_github("rosalieb/serac") （build_vi.nettes 的默认值为 FALSE）。如果他们使用 RStudio，但不使用“常规”R。

我鼓励人们使用 RStudio，但我不能强迫他们，最终，我不明白为什么它在“常规”R 中对我有效，但对他们却无效。

他们试图安装 pandoc、knitr、Rtools——这些都不起作用。

这是我的同事尝试使用 vi.nette 安装 package 时的错误消息：

v  checking for file 'C:\Temp\RtmpO8YwVb\remotesf9842f1431\rosalieb-serac-46a3587/DESCRIPTION'

 
 
 
-  preparing 'serac':
   checking DESCRIPTION meta-information ...
 
   checking DESCRIPTION meta-information ...
 
v  checking DESCRIPTION meta-information

 
 
 
-  installing the package to build vignettes

 
 
 
   creating vignettes ...
 
   creating vignettes ...
 
E  creating vignettes (4.9s)
   --- re-building 'serac.Rmd' using rmarkdown
   Error: processing vignette 'serac.Rmd' failed with diagnostics:
   Pandoc is required to build R Markdown vignettes but not available. Please make sure it is installed.
   --- failed re-building 'serac.Rmd'
   
   RESUME : le traitement du fichier suivant a échoué :
     'serac.Rmd'
   
   Erreur : Vignette re-building failed.
   Exécution arrêtée

Erreur : Failed to install 'serac' from GitHub:
  System command 'Rcmd.exe' failed, exit status: 1, stdout & stderr were printed

在此先感谢您的帮助！

Answer 1

该消息表明rmarkdown::render找不到 Pandoc。

它在三个地方查找它：在RSTUDIO_PANDOC环境变量指定的目录中，在PATH上的目录中，在用户主目录中的目录opt/pandoc中。 因此，安装它的同事应确保它在其中一个位置可用。 他们可以通过运行来查看环境变量的当前值

Sys.getenv("PATH")

和

Sys.getenv("RSTUDIO_PANDOC")

临时更改可以使用

Sys.setenv(RSTUDIO_PANDOC="/path/to/pandoc/directory")

这需要在尝试安装 package 并构建 vi.nette 的 session 中发生，而不是在 vi.nette 本身中发生。

如何对这些值进行永久更改取决于它们运行的系统的详细信息。