繁体   English   中英

所有其他列满足条件的子集行 R

[英]Subset rows where all other columns meet a condition R

您好,我已经尝试了 2 天来解决这个问题,但我一直无法解决,非常感谢您的帮助,我有以下数据框:

在此处输入图像描述

我有 48 列,其中一列称为 orthogroups,另外 47 列是生物名称,在 Orthogroup 列中,行中填满了 orthogroup 名称,而在生物名称列下方,有数字表示 orthogroups 的副本数正交列。

我一直在尝试创建一个子集,在其中减去邻列中所有值都是 0 或 1 的正交组行例如 OG00001 = 1、0、1、0、1 等。我尝试使用此命令

newdf <- subset(Orthogroups.GeneCount, Orthogroups.GeneCount[1:48,] == 1)

或者,如果没有满足条件的Orthogroup ,则在 ax 列数中获取满足条件的行,例如 48 列中至少有 32 列满足条件,并且仅显示满足条件的 32 个正交组,我曾经有一个命令,但我把它弄丢了。 非常感谢您的帮助,我尝试使用dplyr过滤器,但%>%不起作用。

这样的事情应该有效(未测试):

Orthogroups.GeneCount[
  rowSums(Orthogroups.GeneCount[, -1] == 0 |
            Orthogroups.GeneCount[, -1] == 1) == ncol(Orthogroups.GeneCount) - 1, ]

暂无
暂无

声明:本站的技术帖子网页,遵循CC BY-SA 4.0协议,如果您需要转载,请注明本站网址或者原文地址。任何问题请咨询:yoyou2525@163.com.

 
粤ICP备18138465号  © 2020-2024 STACKOOM.COM