[英]Python - from file to data structure?
我有大文件包含~100,000行。 每行对应于一个簇,每一行中的每个条目是另一个文件的参考id(在这种情况下是蛋白质结构),例如
1hgn 1dju 3nmj 8kfn
9opu 7gfb
4bui
我需要在文件中读取列表,其中每行是子列表,从而保持集群的完整性,例如
nested_list = [['1hgn', '1dju', '3nmj', '8kfn'], ['9opu', '7gfb'], ['4bui']]
我当前的代码创建了一个嵌套列表,但每个列表中的条目都是单个字符串,而不是逗号分隔。 因此,我不能轻易地将索引与索引拼接在一起。
任何帮助非常感谢。
谢谢,S :-)
超级简单:
with open('myfile', 'r') as f:
data = [line.split() for line in f]
您将要研究str.split()
方法。
>>> '1hgn 1dju 3nmj 8kfn'.split()
['1hgn', '1dju', '3nmj', '8kfn']
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