在ggplot2 / R中添加指数geom_smooth

Question

我正在尝试使用ggplot2生成一些示例图形，我选择的一个示例是生日问题 ，这里使用来自Oscon的Revolution 计算演示文稿中的“借用”代码。

birthday<-function(n){
    ntests<-1000
    pop<-1:365
    anydup<-function(i){
        any(duplicated(sample(pop,n,replace=TRUE)))
        }
    sum(sapply(seq(ntests), anydup))/ntests
    }

x<-data.frame(x=rep(1:100, each=5)) 
x<-ddply(x, .(x), function(df) {return(data.frame(x=df$x, prob=birthday(df$x)))})
birthdayplot<-ggplot(x, aes(x, prob))+
        geom_point()+geom_smooth()+
        theme_bw()+
        opts(title = "Probability that at least two people share a birthday in a random group")+
        labs(x="Size of Group", y="Probability")

在这里，我的图形是我所描述的指数，但geom_smooth特别不适合数据。 我尝试过黄土方法，但这并没有改变很多东西。 任何人都可以建议如何添加更好的顺利？

谢谢

保罗。

Answer 1

平滑程序对x低值的突然变化没有足够快的反应（并且它无法知道prob的值被限制在0-1范围内）。 由于您具有如此低的可变性，因此快速解决方案是减少每个点平滑处理的值的范围。 看看这个图中的红线：

birthdayplot + geom_smooth(span=0.1, colour="red")

Answer 2

问题是概率遵循逻辑曲线。 如果更改生日函数以返回原始成功和失败而不是概率，则可以使用适当的平滑线。

birthday<-function(n){
  ntests<-1000
  pop<-1:365
  anydup<-function(i){
    any(duplicated(sample(pop,n,replace=TRUE)))
  }
  data.frame(Dups = sapply(seq(ntests), anydup) * 1, n = n)
}
x<-ddply(x, .(x),function(df) birthday(df$x))

现在，您必须将点添加为摘要，并将逻辑回归指定为平滑类型。

ggplot(x, aes(n, Dups)) +
  stat_summary(fun.y = mean, geom = "point") +
  stat_smooth(method = "glm", family = binomial)