使用r中的条件提取唯一行

Question

我有这样的数据：

x <- matrix(c(2,2,3,3,3,4,4,20,33,2,3,45,6,9,45,454,7,4,6,7,5), nrow = 7, ncol = 3)

在真实数据集中，我有一个包含大量列的巨大矩阵。 我想提取相对于第一列（Id）和第三列最小值的唯一行。 例如，我希望这个矩阵

y <- matrix(c(2,3,4,20,3,9,45,4,5), nrow = 3, ncol = 3)

我尝试了很多东西，但我想不出来。 任何帮助表示赞赏。

谢谢，Zeray

Answer 1

这是一个更复杂的版本，但比Chase的ddply解决方案更快 - 大约快200倍:-)

 uniqueMin <- function(m, idCol = 1L, minCol = ncol(m)) {
    t(vapply(split(1:nrow(m), m[,idCol]), function(i, x, minCol) x[i, , drop=FALSE][which.min(x[i,minCol]),], m[1,], x=m, minCol=minCol))
 }

以下测试代码：

nRows <- 10000
nCols <- 100
ids <- nRows/5
m <- cbind(sample(ids, nRows, T), matrix(runif(nRows*nCols), nRows))
system.time( a<-uniqueMin(m, minCol=3L) ) # 0.07
system.time(ddply(as.data.frame(m), "V1", function(x) x[which.min(x$V3) ,])) # 15.72

Answer 2

您可以使用包plyr。 转换为data.frame，以便您可以对第一列进行分组，然后使用which.min按组提取最小行：

library(plyr)
ddply(as.data.frame(x), "V1", function(x) x[which.min(x$V3) ,])
  V1 V2 V3
1  2 20 45
2  3  3  4
3  4  9  5