繁体   English   中英

用Java创建模式数组

[英]Creating a pattern array in Java

这可能是一个非常简单的问题,但是我正在尝试创建一系列模式,并且存在一些问题。 我所做的如下:

Pattern [] aminos = null;
aminos [0] = Pattern.compile("(gct)|(gcc)|(gca)|(gcg)");
aminos [1] = Pattern.compile("(tgt) | (tgc)");
aminos [2] = Pattern.compile("(gat) | (gac)");

在尝试运行它之前,没有语法错误或其他任何内容,但是当我尝试运行它时,它在第二行中断,显示“空指针访问:可变氨基酸只能在此位置为空”。 那我该如何创建一个Pattern数组呢? 当我忽略指定null时,出现了一个错误,要求我初始化数组,所以我不确定现在要做什么。

我想我可以将所有的正则表达式模式存储在字符串数组中,然后编写一个小的函数以根据需要形成模式,但是如果我只可以制作一个模式数组,则将更加方便。

感谢您的阅读!

这是一种简单的方法:

Pattern[] aminos = {
    Pattern.compile("(gct)|(gcc)|(gca)|(gcg)"),
    Pattern.compile("(tgt) | (tgc)"),
    Pattern.compile("(gat) | (gac)")
};

或者,您可以创建大小合适的数组以以下内容开头:

Pattern[] aminos = new Pattern[3];

但这意味着正确计数-第一个版本将自动为您提供合适大小的数组。

或者使用List<Pattern>代替(集合类通常比数组更易于使用):

List<Pattern> aminos = new ArrayList<Pattern>();
aminos.add(Pattern.compile("(gct)|(gcc)|(gca)|(gcg)"));
aminos.add(Pattern.compile("(tgt) | (tgc)"));
aminos.add(Pattern.compile("(gat) | (gac)"));

您必须使用其大小来初始化数组。 Java没有灵活的数组。

Pattern[] aminos = new Pattern[3];
aminos [0] = Pattern.compile("(gct)|(gcc)|(gca)|(gcg)");
aminos [1] = Pattern.compile("(tgt) | (tgc)");
aminos [2] = Pattern.compile("(gat) | (gac)");

如果您不知道会有多少个Pattern ,可以使用如下的ArrayList

ArrayList<Pattern> aminos = new ArrayList<Pattern>();
aminos.add(Pattern.compile("(gct)|(gcc)|(gca)|(gcg)");
...

ArrayList是Java中数组的灵活版本。

暂无
暂无

声明:本站的技术帖子网页,遵循CC BY-SA 4.0协议,如果您需要转载,请注明本站网址或者原文地址。任何问题请咨询:yoyou2525@163.com.

 
粤ICP备18138465号  © 2020-2024 STACKOOM.COM