R无法写入csv或RData文件

Question

我正在尝试将数据帧的内容写入RData文件。

> save(collector2, file="collect2.RData")
Error in save(collector2, file = "collect2.RData") : 
  error writing to connection

作为第二个选项，我尝试使用：

> write.csv(collector2, file="collect2.csv", row.names=FALSE)

这会执行并创建一个文件，但它是空的。

这是我正在尝试编写的数据框：

> head(collector2)
          adQuer1     rowid adQueravg
1 2485651|2284211 132000001 0.0000000
2      20888541|7 132000002 0.0152358
3      20888541|7 132987430 0.0152358
4      20888541|7 132595958 0.0152358
5      20888541|7 132621111 0.0152358
6      20888541|7 132464740 0.0152358
> str(collector2)
'data.frame':   17639105 obs. of  3 variables:
 $ adQuer1  : Factor w/ 7241603 levels "1000467|130715",..: 430440 229948 229948 229948 229948 229948 229948 229948 229948 229948 ...
 $ rowid    : num  1.32e+08 1.32e+08 1.33e+08 1.33e+08 1.33e+08 ...
 $ adQueravg: num  0 0.0152 0.0152 0.0152 0.0152 ...

这是我的系统信息：

> version
               _                            
platform       x86_64-unknown-linux-gnu     
arch           x86_64                       
os             linux-gnu                    
system         x86_64, linux-gnu            
status                                      
major          2                            
minor          15.0                         
year           2012                         
month          03                           
day            30                           
svn rev        58871                        
language       R                            
version.string R version 2.15.0 (2012-03-30)
nickname                                    

有什么建议么？

Answer 1

原来这是一个硬盘问题。 我太空了，这就是信息。

Answer 2

那么你想要坚持的对象并不小。

无论如何，我无法重现错误，但对象大小是我能看到的唯一可能的来源。

数据框中的中间列rowid是double类型，它是64位整数，因此该列包含大部分对象大小。 这表明将此列与其他两个列分开保存 - 即，在两个单独的RData对象中，每个对象都持久保存到自己的文件中。

其次，也许通过传入适当的参数来保存 压缩

数据框大约有。 300K行和9列，我使用gzip压缩将RData对象的大小减少了一点多一点 。

一个9列x大约的数据帧。 300,000行

> dim(FG1)
[1] 282816      9

> dfile = "fg1.RData"

创建一个131 KB的RData文件：

保存（FG1，file = dfile）

创建一个66 KB的RData文件：

save（FG1，file = dfile，compress = TRUE，compression_level = 9）