来自bash脚本的输出循环遍历多个目录

Question

我目前正在尝试编写一个脚本，该脚本将遍历多个目录。 raw_data主目录包含约150个子目录（subj001，subj002，...，subj00n），每个子目录都有几个子目录。

如何确定给定波纹管的脚本输出将发送回输入所来自的特定子目录（例如subj0012），而不是当前目录（raw_data）？

#!/bin/bash

for dir in ~raw_data/*
do
  tractor -d -r -b preproc RunStages:1 
done 

谢谢。

Answer 1

您要将输出保存到的目录的名称在$dir ，对吗？ 因此，只需通过重定向将输出发送到那里即可：

#!/bin/bash
for dir in ~raw_data/* ; do
    tractor -d -r- b preproc RunStages:1 > $dir/output
done

但是，您应该确保要处理的实际上是一个目录。

Answer 2

您可以使用find输出运行循环并将输出附加到所需的位置，如下所示：

while read d
do
    echo $d >> ~raw_data/subj0012/output
done < <(find ~raw_data -type d)