命令行可选参数

Question

所以我仍然在编码，甚至不确定这是否还可以，但是当我什至无法运行它时，很难对其进行测试。 这是我第一次尝试具有多个可选输入，并且每次运行它时，我都会收到错误消息：

“命令行参数错误：参数“ query”。文件不可访问：'sequence_filename'”

命令行输入是一个文件名（必需），然后是函数将运行的可选输出文件，然后是prot（如果是蛋白质，则为反义词）或na（如果是核酸）的可选变量

if __name__ == '__main__':
    sequence_filename = sys.argv[1]
    output_filename = ''
    if sys.argv > 3:
        output_filename = sys.argv[2]
        if sys.argv[3] == 'na':
            input = 'na'
        else:
            input = 'prot'
    elif sys.argv > 2:
        output_filename = sys.argv[2]

    main( sequence_filename, output_filename, input )

提前致谢。

Answer 1

如果您正在执行复杂的命令行界面，则应使用argparse ，它将根据您指定的参数自动解析并创建该界面。

如果您运行的是python 2.6或更早版本，则可以使用optparse （由argparse替换的旧模块）。