读取选项卡分隔文件R中的问题

Question

我试图读取一个如下所示的制表符分隔文件：

我正在使用read.table进行此建议，但我无法读取该文件。

table<- read.table("/Users/Desktop/R-test/HumanHT-12_V4_0_R2_15002873_B.txt",
                   header =FALSE, sep = "\t", 
                   comment.char="#", check.names=FALSE)

当我运行代码时，我有这个错误：

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 1 did not have 2 elements 

读桌子时我做错了什么？ 我对R不熟悉，所以任何帮助都会非常有用。

Answer 1

我对这种类型的文件非常熟悉：它是用于微阵列分析的GEO平台数据。 正如上面提到的baptiste，最好的方法是跳过前几行skip=9 。 您可以用read.delim(...)替换read.table(...,sep="\\t") read.delim(...) 。 然后，您的表格将包含合适的列名称 - 请注意列名称应位于第1行。

然后，如果您对前9行感兴趣，可以通过readLines(...)命令读取它们，并将数据粘贴到表中，方法如下：

foo = read.delim(...)
bar = readLines(...)
baz = list(foo, bar)