Python中的Networkx - 将节点属性绘制为节点外的标签

Question

我有一个具有特定属性的节点图，我想在 Python 中通过 networkx 绘制该图，其中有几个属性作为节点外节点的标签。

有人可以帮助我如何编写代码来实现这一目标吗？

我的代码中有一个循环生成“interface_?” 防火墙列表（fwList）中每个输入的属性

for y in fwList:
    g.add_node(n, type='Firewall')
    print 'Firewall ' + str(n) + ' :' 
    for x in fwList[n]:
        g.node[n]['interface_'+str(i)] = x
        print 'Interface '+str(i)+' = '+g.node[n]['interface_'+str(i)]
        i+=1
    i=1
    n+=1

然后，稍后我绘制节点和边，如：

pos=nx.spring_layout(g)
nx.draw_networkx_edges(g, pos)
nx.draw_networkx_nodes(g,pos,nodelist=[1,2,3],node_shape='d',node_color='red')

并将其扩展到一些具有其他形状和颜色的新节点。

为了标记单个属性，我在下面的代码中尝试过，但没有用

labels=dict((n,d['interface_1']) for n,d in g.nodes(data=True))

为了将文本从节点中取出，我不知道......

Answer 1

您可以访问“pos”字典中的节点位置。 所以你可以使用 matplotlib 把文本放在任何你喜欢的地方。 例如

In [1]: import networkx as nx

In [2]: G=nx.path_graph(3)

In [3]: pos=nx.spring_layout(G)

In [4]: nx.draw(G,pos)

In [5]: x,y=pos[1]

In [6]: import matplotlib.pyplot as plt

In [7]: plt.text(x,y+0.1,s='some text', bbox=dict(facecolor='red', alpha=0.5),horizontalalignment='center')
Out[7]: <matplotlib.text.Text at 0x4f1e490>

Answer 2

除了 Aric 的答案之外， pos字典还包含值中的x, y坐标。 所以你可以操纵它，一个例子可能是：

pos_higher = {}
y_off = 1  # offset on the y axis

for k, v in pos.items():
    pos_higher[k] = (v[0], v[1]+y_off)

然后用新位置绘制标签：

nx.draw_networkx_labels(G, pos_higher, labels)

其中G是您的图形对象并labels字符串列表。

Answer 3

我喜欢创建一个通过偏移量移动布局的nudge功能。

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

def nudge(pos, x_shift, y_shift):
    return {n:(x + x_shift, y + y_shift) for n,(x,y) in pos.items()}

G = nx.Graph()
G.add_edge('a','b')
G.add_edge('b','c')
G.add_edge('a','c')

pos = nx.spring_layout(G)
pos_nodes = nudge(pos, 0, 0.1)                              # shift the layout

fig, ax = plt.subplots(1,2,figsize=(12,6))
nx.draw_networkx(G, pos=pos, ax=ax[0])                      # default labeling
nx.draw_networkx(G, pos=pos, with_labels=False, ax=ax[1])   # default nodes and edges
nx.draw_networkx_labels(G, pos=pos_nodes, ax=ax[1])         # nudged labels
ax[1].set_ylim(tuple(i*1.1 for i in ax[1].get_ylim()))      # expand plot to fit labels
plt.show()

Answer 4

NetworkX 关于draw_networkx_labels的文档还表明，您可以使用horizontalalignment draw_networkx_labels和verticalalignment draw_networkx_labels参数来获得简单、开箱即用的解决方案，而无需手动轻推标签。

从文档：

• 水平对齐 ({'center', 'right', 'left'}) – 水平对齐（默认 ='center'）

• 垂直对齐 ({'center', 'top', 'bottom', 'baseline', 'center_baseline'}) – 垂直对齐 (default='center')

更方便的是，您可以将其与更高级别的 NetworkX 函数一起使用，例如nx.draw()或nx.draw_spectral （或其变体），因为这些更高级别的函数参数接受关键字参数，这些关键字参数依次传递到其较低级别的参数中。级功能。

所以下面的代码是一个最低限度可行的代码，它可以满足您的要求，即推动/微移节点外的标签：

G = nx.DiGraph(name='Email Social Network')
nx.draw(G, arrowsize=3, verticalalignment='bottom')
# or:
nx.draw(G, arrowsize=3, verticalalignment='top')
plt.show()

该verticalalignment对齐的结果如下所示：