一張圖上有多個箱形圖

Question

我從六個文本文件中獲取數據（每個文本文件均包含用換行符分隔的數字）：

args <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)

t0 <- read.table(paste("2_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")
t1 <- read.table(paste("4_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")
t2 <- read.table(paste("6_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")
t3 <- read.table(paste("8_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")
t4 <- read.table(paste("10_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")
t5 <- read.table(paste("12_",args[1],".txt",sep=""), header=FALSE, sep="\n")

我想使用相同的y軸並排創建6個箱型圖。 我曾咨詢過類似的問題 ，但沒有成功。

times <- matrix(c(t0,t1,t2,t3,t4,t5), ncol=6)

png(paste(args[1],".png",sep=""))
boxplot(x = as.list(as.data.frame(times)))
dev.off()

這將產生以下錯誤：

Error in sort.int(x, na.last = na.last, decreasing = decreasing, ...) : 
  'x' must be atomic
Calls: boxplot ... boxplot.stats -> <Anonymous> -> sort -> sort.default -> sort.int

我很難理解我要去哪里。 如果有人可以引導我進入寫路徑或提出實現我的目標的另一種方法，將不勝感激。

謝謝。

編輯

根據要求，以下是可復制的示例。

c_graph.r ：

#!/usr/bin/env Rscript

t0 <- read.table("t0.txt",header=FALSE, sep="\n")
t1 <- read.table("t1.txt",header=FALSE, sep="\n")
t2 <- read.table("t2.txt",header=FALSE, sep="\n")

times <- matrix(c(t0,t1,t2), ncol=3)

png("test.png")
boxplot(x = as.list(as.data.frame(times)))
dev.off()

t0.txt ， t1.txt ， t2.txt （所有內容相同）：

5287
5287
58
2
525
8
758
7587
587

運行代碼：

Rscript c_graph.r

結果：

Error in sort.int(x, na.last = na.last, decreasing = decreasing, ...) : 
  'x' must be atomic
Calls: boxplot ... boxplot.stats -> <Anonymous> -> sort -> sort.default -> sort.int

Answer 1

當您將已讀入的文件轉換為矩陣時，會發生問題。 考慮：

set.seed(90)

t0 <- rnorm(9)
t1 <- rnorm(9)
t2 <- rnorm(9)

times1 <- matrix(c(t0,t1,t2), ncol=6)
> times1
           [,1]       [,2]        [,3]        [,4]       [,5]       [,6]
[1,]  0.0771813  0.4425903 -0.80517064 -0.05976005 -0.5882710  0.1291539
[2,] -0.1510609  1.0055101 -0.08230689 -0.34302853 -0.1315423 -0.3980679
[3,] -0.8840764  0.9144189  0.86718542  0.87410829  1.3159242  0.0771813
[4,] -0.7205931 -0.5663887  1.65919765  0.97977040 -1.2910153 -0.1510609
[5,]  0.7407430  2.3930961 -0.24084853 -0.76047498 -0.3720799 -0.8840764


t0 <- read.table("t0.txt",header=FALSE, sep="\n")
t1 <- read.table("t1.txt",header=FALSE, sep="\n")
t2 <- read.table("t2.txt",header=FALSE, sep="\n")

times2 <- matrix(c(t0,t1,t2), ncol=3)
> times2
     [,1]      [,2]      [,3]     
[1,] Integer,9 Integer,9 Integer,9

這有效：

times3 <- data.frame(t0,t1,t2)
windows()
  boxplot(times3)

Answer 2

通過將數據從data.frame轉換為matrix似乎會遇到麻煩。 您創建一個data.frames c(t0,t1,t2)列表，但只需要數字值。

因此，您必須通過直接訪問該列來從data.frame中提取每個元素：

matrix(c(t0$V1, t1$V1, t2$V1), ncol=3)

或者您可以使用unlist ：

matrix(unlist(c(t0, t1, t2)), ncol=3)

為了避免所有麻煩，請用scan替換您的read.table ：

t0 <- scan("t0.txt")