在Shell Script Linux中重命名文件

Question

我想重命名從以下腳本下載的文件：

exec < input_list.txt
while read line
do
get $line
wget ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/$2/$4
# Rename $4
mv $4 $1"_"$3".bam"
done

輸入文件（input_list.txt）由制表符分隔，並包含四列。 第一個是$ 1 =名稱，$ 2 = wget地址，$ 3 =因數，$ 4是文件名。

A549    wgEncodeBroadHistone    H2azDex100nm    wgEncodeBroadHistoneA549H2azDex100nmAlnRep1.bam

我想將$ 4（已下載的文件）重命名為較短的文件名，該文件名僅包含相應的$ 1​​和$ 3條款。 例如， wgEncodeBroadHistoneA549H2azDex100nmAlnRep1.bam變為A549_H2azDex100nm.bam

我玩過"但我不斷收到有關mv命令的錯誤消息，並且$4是一個錯誤的變量名。任何建議將不勝感激。

Answer 1

如果使用wget的-O選項，則無需重命名文件：

#!/bin/bash

[ -n "$BASH_VERSION" ] || {
    echo "You need Bash to run this script."
    exit 1
}

while IFS=$'\t' read -a INPUT; do
    wget -O "${INPUT[0]}_${INPUT[2]}.bam" "ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/${INPUT[1]}/${INPUT[3]}"
done < input_list.txt

確保以UNIX文件格式（如script.sh保存文件，然后運行bash script.sh 。