在Shell Script Linux中重命名文件

Question

我想重命名从以下脚本下载的文件：

exec < input_list.txt
while read line
do
get $line
wget ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/$2/$4
# Rename $4
mv $4 $1"_"$3".bam"
done

输入文件（input_list.txt）由制表符分隔，并包含四列。 第一个是$ 1 =名称，$ 2 = wget地址，$ 3 =因数，$ 4是文件名。

A549    wgEncodeBroadHistone    H2azDex100nm    wgEncodeBroadHistoneA549H2azDex100nmAlnRep1.bam

我想将$ 4（已下载的文件）重命名为较短的文件名，该文件名仅包含相应的$ 1​​和$ 3条款。 例如， wgEncodeBroadHistoneA549H2azDex100nmAlnRep1.bam变为A549_H2azDex100nm.bam

我玩过"但我不断收到有关mv命令的错误消息，并且$4是一个错误的变量名。任何建议将不胜感激。

Answer 1

如果使用wget的-O选项，则无需重命名文件：

#!/bin/bash

[ -n "$BASH_VERSION" ] || {
    echo "You need Bash to run this script."
    exit 1
}

while IFS=$'\t' read -a INPUT; do
    wget -O "${INPUT[0]}_${INPUT[2]}.bam" "ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/${INPUT[1]}/${INPUT[3]}"
done < input_list.txt

确保以UNIX文件格式（如script.sh保存文件，然后运行bash script.sh 。