[英]Batch Renaming of Files in Linux Shell
我在远程集群上通过 ssh 工作,需要根据方案重命名一些文件。 重命名应该像这样工作:
M-19-3778_P1-DX5-K47-232-Elev_A1-A1_L001_R1_001.fastq.gz
进M-19-3778-P1-DX5-K47-232-Elev-A1-A1L001_R1.R.fq.gz
M-19-3778_P1-DX5-K47-232-Elev_A1-A1_L001_R2_001.fastq.gz
进M-19-3778-P1-DX5-K47-232-Elev-A1-A1L001_R1.F.fq.gz
M-19-3779_P1-F48-F37-86-Cont_A2-A2_L001_R1_001.fastq.gz
进入M-19-3779-P1-F48-F37-86-Cont-A2-A2L001_R2.R.fq.gz
M-19-3779_P1-F48-F37-86-Cont_A2-A2_L001_R2_001.fastq.gz
进入M-19-3779-P1-F48-F37-86-Cont-A2-A2L001_R2.F.fq.gz
...
M-19-3830_P1-DX5-D12-221-Elev_F9-F9_L001_R1_001.fastq.gz
进M-19-3830-P1-DX5-D12-221-Elev-F9-F9L001_R53.R.fq.gz
M-19-3830_P1-DX5-D12-221-Elev_F9-F9_L001_R2_001.fastq.gz
进M-19-3830-P1-DX5-D12-221-Elev-F9-F9L001_R53.F.fq.gz
迭代仅在名称的开头以 3778....
到目前为止,我已经尝试使用grep
/ sed
/ cat
的组合,但没有成功。 而且我不知道如何处理名称R1
, R2
,...末尾的迭代,我的猜测是for
循环和if
-Statement 的组合,但我只是没有让它运行。
如果有任何帮助,我将不胜感激!
i=1
for name in *
do
newName=${name%_L001_R1_001.fastq.gz}L001_R$i.R.fq.gz
mv "$name" "$oldname"
((i++))
done
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