[英]select dataframes from a list based on column values
這個問題是從先前的另一個問題改編而來的。
我使用R,僅在其中一列中存在特定值組合時,才嘗試通過從現有列表中選擇數據框來創建數據框的新列表。 讓我解釋一下可以正常工作的第一步。 這是我在名為df的數據框中的原始數據:
Taxon C N func.group trophic.grp
1 Chrysomelidae.Phylotreta.exclamationis -30.23 5.06 grazer herbivore
2 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.29 5.55 grazer herbivore
3 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.84 5.54 grazer herbivore
4 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.69 4.59 grazer herbivore
5 Mitidulidae.Meligethes.sp. -26.99 5.30 grazer herbivore
6 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.50 2.40 grazer herbivore
7 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.36 4.17 grazer herbivore
8 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -29.50 3.15 grazer herbivore
9 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -27.69 3.72 grazer herbivore
10 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.22 3.26 grazer herbivore
11 Gastropoda.snail.sp.1 -26.21 3.54 grazer herbivore
12 Gastropoda.snail.sp.1 -27.59 2.61 grazer herbivore
13 Gastropoda.snail.sp.1 -25.10 2.66 grazer herbivore
14 Gastropoda.snail.sp.2 -26.49 2.55 grazer herbivore
15 Gastropoda.snail.sp.4 -27.46 -0.38 grazer herbivore
16 Lepidoptera.Arctidae.Ermine.moth -28.51 2.44 grazer herbivore
17 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.06 2.19 weevil herbivore
18 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.27 1.60 weevil herbivore
19 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.94 2.08 weevil herbivore
20 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.71 2.16 weevil herbivore
21 Curculionidae.Protapion.sp. -28.45 1.91 weevil herbivore
22 Curculionidae.Protapion.sp. -25.99 0.55 weevil herbivore
23 Curculionidae.Protapion.sp. -28.27 1.52 weevil herbivore
24 Curculionidae.Protapion.sp. -28.01 1.74 weevil herbivore
25 Curculionidae.Protapion.sp. -27.06 0.54 weevil herbivore
26 Curculionidae.Hypera.meles -25.41 3.38 weevil herbivore
27 Curculionidae.Sitona.sp. -27.05 2.01 weevil herbivore
28 Curculionidae.Sitona.sp. -26.70 3.07 weevil herbivore
29 Curculionidae.Sitona.sp. -27.64 2.13 weevil herbivore
30 Curculionidae.Sitona.sp. -27.50 1.47 weevil herbivore
31 Curculionidae.Phylobius.sp. -28.27 2.66 weevil herbivore
32 Curculionidae.Hypera.nigrorostris -25.52 2.43 weevil herbivore
此數據幀(df)包含14個不同的“ Taxon”,其中一些具有多個樣本,因此總共有32個樣本。 每個分類單元也通過“ func.group”列分類為“放牧者”或“象鼻蟲”。
首先,我想從14中隨機選擇6個分類單元,以實現6個所有可能的組合。因此,可以從14個中選擇3003個6個分類單元的組合(隨機抽樣而不進行替換,順序並不重要)。 對於每個選定的分類單元,我要包括該分類單元的所有樣本。 我使用此代碼,效果很好:
combos<-combn(unique(as.character(df$Taxon)), 6)
接下來,我還希望包括所有其他信息列,因此我將使用此額外的代碼行,對於所選的每個Taxon,它會添加其他數據列,並且效果很好:
mysamples <- apply(combos, 2, function(vec) df[ df$Taxon %in% vec, ] )
這樣我們就解決了我的問題。 從“ mysamples”(現在應該是3003個數據框的列表)中,我要選擇在3個Taxon中包括“ grazer”和在3 Taxon中包括“ weevil”的所有數據框,並將這些數據框存儲在新清單。
因此,我希望這個新列表僅包含平衡為3:3 weevil:grazer Taxon的數據框,
非常感謝,M
我認為您正在尋找mysamples中所有具有3個象鼻蟲和3個放牧者的元素。 您可以執行以下操作:
# Get list of bool for whether to include
include.list <- lapply(mysamples, function(x) sum(x$func.group == "weevil") == 3 &
sum(x$func.group == "grazer") == 3)
# Limit mysamples to the selected ones
mysamples <- mysamples[do.call(c, include.list)]
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