檢查R軟件包的安裝版本並更新（如果較舊）

Question

我們正在通過puppet在集群中管理R軟件包，並且我們已經創建了一個文件，其中包含如下命令。 我們內部有R包回購的鏡像。

install.packages（“ BH”，repos = NULL，依賴關系= TRUE，contriburl = http：//our_internal_repo.com ）

在rPackages.xt中

我們通過RScript rPackages.txt執行此使用using的操作

現在，在下周，我們將獲得3個其他軟件包，我們將rPackages修改為包括新軟件包的其他行。

現在，由於scirpt將從頭到尾讀取，因此它將嘗試重新安裝所有軟件包。

我的問題是，僅當安裝的版本與我們內部倉庫中的版本不相同時，才如何安裝軟件包。

如何在RScript中執行這些檢查並相應執行木偶。

管理R安裝的最佳實踐是什么？

謝謝

Answer 1

將Rscript更改為

if("BH" %in% rownames(installed.packages()) == FALSE) {install.packages("BH")}

至於版本，您可能會以某種方式使用packageVersion 。