如何在舊的不兼容版本的R上安裝新的R包

Question

由於公司的IT要求，我被迫使用R 3.2.2。 我需要使用一些技術上要求R> 3.2.2的軟件包（主要是2版或更高版本）。 我知道有時可以“欺騙”該程序包使其在較舊的，不兼容的R版本中運行，但是我不確定如何執行此操作。

我使用較新版本的R下載了該軟件包，然后按照Patrick在這里建議的那樣調整了描述文件（ 如何從基於R-3.4.0構建的GitHub將R軟件包安裝到R-3.3.0？ ），以及將軟件包文件移到了R 3.2.2庫路徑中，但是沒有用。 我收到錯誤“錯誤：這是R 3.2.2，程序包'prophet'需要> = 3.2.3”。

有人有想法/建議嗎？ 謝謝！

Answer 1

預先說明：@prosoitos關於使用較舊版本軟件包的評論可能是最好的選擇，如果可以找到的話。 我相信MRAN聲稱所有軟件包的日常版本都可以追溯到很長時間 ，還有checkpoint軟件包可以凍結項目的軟件包狀態。 實際上，嘗試使用該程序包，可能會使以下幾個“技巧”（請不要隨便使用它們）變得不必要。

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確實有些軟件包可能“錯誤地要求R版本”，而是方便地選擇開發人員正在使用的R版本和/或從其他軟件包復制的任意版本。 然而：

1. 在不了解軟件包代碼內部的情況下，您無法知道是否是真正的要求。

   如果開發人員認真地使用適當定義的R版本要求，則可以瀏覽包的提交歷史記錄（假設github，gitlab或其他一些可訪問的版本控件），並在DESCRIPTION查找R版本的更改時間，然后查看以前的提交以查看哪些更改建議版本增加。 如果幸運的話，提交消息本身會說類似“添加參數xyz =，要求使用新的R”之類的字詞 ，但是我懷疑這並不能保證，甚至不可能。

2. 缺少這一點，可能有一個功能（舊版或新版）需要R的較新版本，但沒有其他更改。 在我看來，這似乎是合理的，並且可能還需要進行一些偵查才能確認。

3. 即使您發現了此問題，也可能取決於具有類似定義的版本要求的其他軟件包。 因此，即使您為一個程序包解決了問題，它也可能會級聯成幾個或幾十個程序包。 （提示：也許checkpoint看起來更好，因為它對此有所幫助。）

如果您以某種方式確定（a）您知道R版本要求是錯誤的，或者（b）您知道其要求是什么，並且您願意在沒有這些參數或函數的情況下生活，那么：

1. 克隆或下載源代碼；
2. 編輯DESCRIPTION並更改R版本，建議您也更改軟件包的版本號，以便知道所使用的版本。 並且您還應該注意其他軟件包的版本要求，因為這可能暗示API發生了更改等； 和
3. 生成/安裝本地版本。

但是...可能會有細微差別的代碼（和/或文檔中的示例代碼）在舊版本中不起作用。 而且，對一個軟件包有效的方法不一定對另一個軟件包有效。

這是買權人的真實情況。 代碼破解的風險很高。 必須對多個程序包執行此手動過程的可能性很高。 第一次全部起作用的可能性很小。

（當然，您可以隨時與開發人員/維護人員聯系。）

Answer 2

這不是您問題的確切答案。 但是您是否聽說過conda軟件包管理器（它對於編程語言和許多其他與系統相關的程序是通用的）？

您可以通過在虛擬conda環境中本地安裝更高版本的R，並在虛擬環境中運行它來解決頭痛（無需管理員權限）。

要學習使用conda，請使用Corey Schafer的教程非常好-並在12分鍾內教會您conda...。 Anaconda只是一個變體，但我使用miniconda-產品和命令是相同的。

# install miniconda on linux 64 bit on python 3.7 background
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

# linux 32 bit python 3.7
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86.sh

# windows 64 bit python 3.7
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe
# and run it 

# windows 32 bit python 3.7
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86.exe
# and run it

# other combinations and conditions and operating systems and python 2.7
# https://conda.io/miniconda.html

# after installation, in terminal, conda is available from 
# wherever you are.
# create conda environment for R-3.5.1 the newest
conda create --name R351
# enter the virtual environment
source activate R351
# install R-3.5.1
conda install -c r r-base
# start R
R
# quit R and quit the environment
source deactivate

我長時間搜索了這樣的版本問題。 這是最干凈的解決方案...

但是實際上也沒有conda，您可以只在本地安裝更高的R版本（為此，您不需要sudo權限）並運行“ /path/to/your/local/R-3.5.1/bin/R”-例如我確實做到了 您從此處獲得的二進制文件或資源。 但是，在這種情況下，您通常必須以管理員身份安裝軟件包。

使用.libPath()函數，您可以完全控制應訪問/不使用哪些庫（位於文件夾中）。 看這里 。