在Lyx中用Knitr繪圖

Question

我正在嘗試在Lyx中使用Knitr進行繪圖。 當我跑步

<<>>=
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

我得到錯誤

LaTeX Error: File `figure/unnamed-chunk-6.eps.bb' not found.

我嘗試在起始括號中包含擴展名，但沒有成功。 我如何得到我的情節？

---

按照第一個答案，嘗試以下操作：

定義功能（不是很重要，只是為了說明如何獲得）

<<>>=
exp.loglik <- function(lambda, obs){   
    xbar = mean(obs)   
    return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar) 
}
@

定義y（不那么重要，僅包括顯示y的定義）

<<>>=
y = rep(NA,1000) 
for (i in 1:1000){   
    y[i] = exp.loglik(lambda=i/10000, obs=diet_data$survtime)   
}
@

運行代碼，然后發生錯誤（請注意，已按照說明將軟件包安裝在純R中）

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>=
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

相同的錯誤：LaTeX錯誤：找不到文件`figure / unnamed-chunk-6.eps.bb'。

Answer 1

首先，單獨安裝軟件包，僅在純R中運行install.packages 。第二，您不定義y 。

這是一個不顯示R代碼，警告或消息而生成繪圖的最小示例：

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=10:1, x=1:10, main = 'Log-Likelihood') 
@

---

編輯 ：

我正在運行以下代碼：

<<>>= 
exp.loglik <- function(lambda, obs) {        
  xbar = mean(obs)        
  return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar)  
}
@

<<>>= 
y = rep(NA,5)  
for (i in 1:5) {        
  y[i] = exp.loglik(lambda=i/5, obs=runif(5))    
} 
@

<<warning=FALSE, message=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=y, x=1:5, main = 'Log-Likelihood') 
@

然后我得到一張照片。 您的代碼在干凈的R中工作嗎？ 只需重新運行它以確保它是。 如果一切正常，則可能是LATEX / knitr安裝。