在Lyx中用Knitr绘图

Question

我正在尝试在Lyx中使用Knitr进行绘图。 当我跑步

<<>>=
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

我得到错误

LaTeX Error: File `figure/unnamed-chunk-6.eps.bb' not found.

我尝试在起始括号中包含扩展名，但没有成功。 我如何得到我的情节？

---

按照第一个答案，尝试以下操作：

定义功能（不是很重要，只是为了说明如何获得）

<<>>=
exp.loglik <- function(lambda, obs){   
    xbar = mean(obs)   
    return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar) 
}
@

定义y（不那么重要，仅包括显示y的定义）

<<>>=
y = rep(NA,1000) 
for (i in 1:1000){   
    y[i] = exp.loglik(lambda=i/10000, obs=diet_data$survtime)   
}
@

运行代码，然后发生错误（请注意，已按照说明将软件包安装在纯R中）

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>=
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

相同的错误：LaTeX错误：找不到文件`figure / unnamed-chunk-6.eps.bb'。

Answer 1

首先，单独安装软件包，仅在纯R中运行install.packages 。第二，您不定义y 。

这是一个不显示R代码，警告或消息而生成绘图的最小示例：

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=10:1, x=1:10, main = 'Log-Likelihood') 
@

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编辑 ：

我正在运行以下代码：

<<>>= 
exp.loglik <- function(lambda, obs) {        
  xbar = mean(obs)        
  return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar)  
}
@

<<>>= 
y = rep(NA,5)  
for (i in 1:5) {        
  y[i] = exp.loglik(lambda=i/5, obs=runif(5))    
} 
@

<<warning=FALSE, message=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=y, x=1:5, main = 'Log-Likelihood') 
@

然后我得到一张照片。 您的代码在干净的R中工作吗？ 只需重新运行它以确保它是。 如果一切正常，则可能是LATEX / knitr安装。