R-如何設置閃亮服務器的install.packages（）路徑？ -Ubuntu

Question

對於我的系統：每當我通過R在R中安裝自定義軟件包時， Ubuntu 12.04和R 3.03

>install.packages()

該軟件包默認安裝為

/home/USER/R/x86_64-pc-linus-gnu-library/3.0/ 

與系統范圍內的

/usr/local/lib/R/site-library/

閃亮服務器才能使用該軟件包。

我的臨時解決方案是將程序包復制到正確的文件夾中。

問題：如何從一開始就設置默認安裝路徑，以避免出現此問題？

Answer 1

是的-我認為這是功能不當，並禁用了每個用戶的目錄。

此外，我主要使用腳本install.r （該版本的示例可以作為Ubuntu的一部分安裝在littler軟件包中），該腳本簡單地將/usr/local/lib/R/site-library目錄設置為默認。 使用我們加入R 3.0.2或3.0.3的補丁程序，普通用戶可以寫入目錄，現在將創建可寫組的目錄，以便其他用戶可以更新和覆蓋-只需使每個人都屬於同一組即可，例如staff或admin 。 然后，您甚至不需要sudo或root。

多年來，我已經在這里多次回答了相同的問題（減去了發亮的角度，這並不是很重要），因此隨時可以搜索其他詳細信息，示例...

Answer 2

我會提出另一種方法。

問題是Shiny-server找不到您安裝的軟件包，因為它以另一個用戶身份運行它們，即所謂的shiny 。 該用戶是在安裝Shiny-server時創建的

解決此問題的最簡單（最安全的恕我直言）的方法是，按照以下步驟，以閃亮的用戶身份安裝軟件包。

1. 使用sudo passwd shiny為用戶設置密碼，現在輸入並確認您選擇的密碼。
2. 使用以下命令切換到閃亮帳戶： su - shiny
3. 調用R使用$ R （沒有sudo）
4. 安裝所需的軟件包，在這種情況下：`install.packages（“ shinydashboard”）

請注意，如果您在同一台計算機上安裝了rstudio-server，則可以使用該界面執行步驟2-4。 只需轉到相同的域/ ip，然后將：8787用於rstudio-server接口，而不是：3838用於Shiny-server。

從這里我的答案改編