R-如何设置闪亮服务器的install.packages（）路径？ -Ubuntu

Question

对于我的系统：每当我通过R在R中安装自定义软件包时， Ubuntu 12.04和R 3.03

>install.packages()

该软件包默认安装为

/home/USER/R/x86_64-pc-linus-gnu-library/3.0/ 

与系统范围内的

/usr/local/lib/R/site-library/

闪亮服务器才能使用该软件包。

我的临时解决方案是将程序包复制到正确的文件夹中。

问题：如何从一开始就设置默认安装路径，以避免出现此问题？

Answer 1

是的-我认为这是功能不当，并禁用了每个用户的目录。

此外，我主要使用脚本install.r （该版本的示例可以作为Ubuntu的一部分安装在littler软件包中），该脚本简单地将/usr/local/lib/R/site-library目录设置为默认。 使用我们加入R 3.0.2或3.0.3的补丁程序，普通用户可以写入目录，现在将创建可写组的目录，以便其他用户可以更新和覆盖-只需使每个人都属于同一组即可，例如staff或admin 。 然后，您甚至不需要sudo或root。

多年来，我已经在这里多次回答了相同的问题（减去了发亮的角度，这并不是很重要），因此随时可以搜索其他详细信息，示例...

Answer 2

我会提出另一种方法。

问题是Shiny-server找不到您安装的软件包，因为它以另一个用户身份运行它们，即所谓的shiny 。 该用户是在安装Shiny-server时创建的

解决此问题的最简单（最安全的恕我直言）的方法是，按照以下步骤，以闪亮的用户身份安装软件包。

1. 使用sudo passwd shiny为用户设置密码，现在输入并确认您选择的密码。
2. 使用以下命令切换到闪亮帐户： su - shiny
3. 调用R使用$ R （没有sudo）
4. 安装所需的软件包，在这种情况下：`install.packages（“ shinydashboard”）

请注意，如果您在同一台计算机上安装了rstudio-server，则可以使用该界面执行步骤2-4。 只需转到相同的域/ ip，然后将：8787用于rstudio-server接口，而不是：3838用于Shiny-server。

从这里我的答案改编