在 h5py 數據集中添加或刪除特定的行或列

Question

創建h5py 數據集后，如何在 NxM 數組中添加或刪除特定行或列？

我的問題與此類似，但我不想盲目地截斷或擴展數組。 刪除時，我需要能夠指定要刪除的確切行或列。

對於添加，我知道我必須在創建初始數據集時指定maxshape=(None, None) ，但是resize方法似乎不允許您指定如果縮小大小，哪些行或列會被截斷。

Answer 1

h5py 並不是真正為這樣做而設計的。 Pandas可能是一個更好用的庫，因為它是圍繞表的概念構建的。

話雖如此，這是如何做到的：

In [1]: f = h5py.File('test.h5')

In [2]: arr = rand(4,4)

In [3]: dset = f.create_dataset('foo',data=arr,maxshape=(2000,2000))

In [4]: dset[:]
Out[4]:
array([[ 0.29732874,  0.59310285,  0.61116263,  0.79950116],
       [ 0.4194363 ,  0.4691813 ,  0.95648712,  0.56120731],
       [ 0.76868585,  0.07556214,  0.39854704,  0.73415885],
       [ 0.0919063 ,  0.0420656 ,  0.35082375,  0.62565894]])

In [5]: dset[1:-1,:] = dset[2:,:]

In [6]: dset.resize((3,4))

In [7]: dset[:]
Out[7]:
array([[ 0.29732874,  0.59310285,  0.61116263,  0.79950116],
       [ 0.76868585,  0.07556214,  0.39854704,  0.73415885],
       [ 0.0919063 ,  0.0420656 ,  0.35082375,  0.62565894]])

這將從dset刪除第 1 列。 它通過在將數據集縮小一列之前將第 2 列和第 3 列分別分配給 1 和 2 來實現。 交換下標以刪除第 1 行。如果您要經常這樣做，您可以輕松地圍繞它編寫一個包裝器。