Java中如何生成graphml文件。Gephi、JGraph、Prefuse等

Question

幫助！ 我希望創建一個Java 應用程序，它可以生成以下任一格式的圖形：

• .graphml
• .ygf
• .gml
• .tgf

我需要能夠在圖形編輯器“ yEd ”中打開文件。

到目前為止，我已經找到了這些解決方案：

1. yFiles 為 Java
   • Pro：導出為 graphml，能夠在 yEd 中打開，基於 Java，完美。
   • 為什么我不能使用它：使用它會花費我超過2000 美元:( 然而這正是我所需要的
2. 蓋菲
   • Pro：免費，導出為 graphml，基於 Java！
   • 為什么我不能使用它：當我嘗試在 yEd 中打開生成的 graphml 文件時， graphml 被破壞了：它是線性的 - 一行，就像這個截圖：
   • 
   • 如果我讓它工作，那就完美了
   • 我嘗試的圖表是使用他們的示例項目生成的
3. JGraphX
   • Pro：能夠生成圖表，基於 Java，免費
   • 為什么我不能使用它：How to export the generated graph to graphml? 我想不通...
4. 預置
   • Pro：免費，圖形生成，基於 Java
   • 我不能使用它的地方：好像我只能讀 graphml ，而不能寫 graphml 。 另外，我用 build.sh 全部構建了演示，但是當我嘗試運行 demos.jar 時，我得到“無法加載主類”...
5. 帶有GraphML Reader 和 Writer 庫的藍圖（ Tinkerpop ？）
   • Pro: Java，免費，好像你可以用它導出 graphml
   • 為什么我不能使用它：我很困惑，我需要將它與列出的“實現”之一結合使用嗎？ 我該如何使用它？
6. JGraphT與GraphMLExporter
   • Pro：能夠生成圖形，基於 Java，免費，我認為可以導出到 graphml
   • 為什么我不能使用它：我不知道如何導出它，當我試圖在 yed 中打開生成的 graphml 時，我得到“ yEd遇到以下錯誤：無法導入文件 test.graphml ”。 我使用了他們的示例項目，並這樣做了：

我使用的 JGraphT 代碼：

UndirectedGraph<String, DefaultEdge> g = new SimpleGraph<String, DefaultEdge>(DefaultEdge.class);

String v1 = "v1";
String v2 = "v2";
String v3 = "v3";
String v4 = "v4";

// add the vertices
g.addVertex(v1);
g.addVertex(v2);
g.addVertex(v3);
g.addVertex(v4);

// add edges to create a circuit
g.addEdge(v1, v2);
g.addEdge(v2, v3);
g.addEdge(v3, v4);
g.addEdge(v4, v1);


FileWriter w;
try {
GmlExporter<String, DefaultEdge> exporter = 
    new GmlExporter<String, DefaultEdge>(); 
    w = new FileWriter("test.graphml");
    exporter.export(w, g);
} catch (IOException e) {
    e.printStackTrace();
}

有任何想法嗎？ 謝謝！

Answer 1

回答可能為時已晚，但對於第二個解決方案：將圖形導入yEd后，只需單擊“布局”並選擇一個。 yed不會為你選擇一個作為默認值，這就是為什么它似乎是線性的。

Answer 2

我不知道這是否適合您的用例，但我使用neo4j創建圖形，然后使用neo4j-shell-tools將圖形導出為graphml。 也許這對你有用。

Answer 3

只需在代碼中用GraphMLExporter替換每次出現的GmlExporter GraphMLExporter 。 這應該工作。

Answer 4

我也想為yED導出JgraphT圖，但對結果不滿意。 因此，我創建了一個擴展的GMLWriter，支持yED的特定GML格式（組，顏色，不同邊緣......）。

GML-作家換YED

Answer 5

我正在使用de Prefuse庫，您可以使用de class GraphMLWriter從Graph對象生成GraphML文件。

Answer 6

我創建了一個小教程/Github Repo和示例代碼，介紹如何使用 JgraphT 的類導出到 GraphML 和 GML，以及結果在 yED 中的樣子。

正如另一個答案中已經提到的，如果您不想自己做太多配置， GML-Writer-for-yED可能會很方便。