標簽[gephi] - 堆棧內存溢出

[英]Gephi 0.10.1 'Unexpected exception' error during initialization of the Overview tab

我從https://gephi.org/users/download/為 Windows 安裝了 Gephi 0.10.1，但是 Overview 選項卡的初始化需要很長時間，我無法查看任何圖表（包括像 Les Miserables.gexf 這樣的測試圖表）。右下角的“禁止進入”小標志顯示“意外 ...

如何阻止 Gephi 在導入時擦除 MySQL 節點表中的“ID”列並用自動增量列代替

[英]How can I stop Gephi from erasing the `ID` column in a MySQL nodes table on import and substituting an auto-increment column in its place

預期的行為是簡單地從 MySQL 導入節點數據而不進行更改：但是，Gephi 正在擦除 ID 列中的所有數據，並將其替換為自動遞增的 ID 列：當然會導致導入邊緣的錯誤：導入查詢沒有什么特別之處：節點查詢：SELECT * FROM GEPHI_nodes 邊緣查詢：SELECT * ...

如何獲取加權 PageRank 的 R Igraph 值以匹配 Gephi

[英]How to get R Igraph values for a weighted PageRank to match Gephi

我正在努力從 R 中的 igraph 獲取我的 PageRank 值，以匹配我從 Gephi 獲得的值。我遵循了這個例子： https://www.briggsby.com/personalized-pagerank我的 igraph 值與這個例子的加權值相匹配。但是 Gephi 為加權 Pa ...

從 Neo4j 導出數據到 Gephi 沒有顯示所有節點

[英]Exporting data from Neo4j to Gephi is not showing all nodes

我在將數據（節點和關系）從 neo4j 提取到 gephi 時遇到了真正的問題。我正在使用 apoc.gephi.add 方法來做到這一點。此方法僅在 neo4j 查詢中提取節點和關系的隨機子集！您可以在下面找到從 neo4j 提取到 gephi 的密碼查詢： Neo4j 顯示 300 ...

標簽在節點的圓圈下 Gephi

[英]Label are under the node's circle Gephi

我對最新版本的 Gephi 有疑問。一開始，它工作正常。在概覽選項卡中，它運行良好。標簽顯示在圓圈上，如下所示。但是，在預覽選項卡中，它不起作用。標簽顯示在圓圈下方，如下所示。我需要將圓圈上的標記可視化，如概覽表中所示。 ...

networkx position 圖中間的（最大）節點

[英]networkx position (biggest) nodes in the middle of a graph

我一直在使用 the.networkx package 創建圖表，一切正常。我想通過將更大的節點放在圖表的中間來使圖表更好，而來自.networkx 的布局函數似乎無法完成這項工作。節點代表度的大小（連接度越高的節點越大）。有什么方法可以對這些圖進行編程，使較大的節點位於中間？它不必是自動化 ...

刪除 Gephi 中的節點

[英]Remove nodes in Gephi

我在 Gephi 中有一個圖，我需要刪除具有少於 10 個鄰居的節點，或者換句話說 - 將具有超過 10 個鄰居的節點留在圖中。我想過一些過濾器，但我找不到哪個過濾器可以給我這個請求...... 我該怎么做？ ...

使用 Python 或 R 為 Gephi 准備數據

[英]Preparing data for Gephi with Python or R

我目前正在嘗試為 Gephi 中的網絡分析准備我的數據。我有以下格式的數據：原始數據我需要這種格式的數據（The.network 是定向的，從最終端口到外國初始端口，從外國初始端口到美國端口。同一行中的值的權重相同）：格式化數據 ...

Gephi - 帶有彩色節點的 open.networkx

[英]Gephi - open networkx with colored nodes

我有一個相當大的網絡（34594 個節點和 3897 個邊）。我在 Python 中創建了一個 Networkx.network，並根據節點的 label 為節點賦予顏色。 label 根據開頭字母將節點鏈接到 5 個國家。在 Python 中，一切正常，但出於可視化目的，我導出文件 (.g ...

如何在 Gephi 中打開超過 30.000 個節點的網絡

[英]How to open networks over 30.000 nodes in Gephi

我在 Windows 10（64x，8Gb RAM）中運行 Gephi 0.9.2，在 30.000 個節點下具有正常性能 in.networks。當我嘗試使用更大的數據集時，程序就會崩潰。有時它發生在程序剛打開時；其他人在應用 ForceAtlas2 時發生。我試圖將 gephi.conf ...

Gephi 上沒有顯示頂部條形圖或圖表

[英]No top bar or graph shown on Gephi

這是我第一次使用 Gephi（版本 0.9.2），當我進入時，我得到了這個屏幕。現在，當我選擇其中一個 .gexf 文件時，一切似乎都很順利...... ，但隨后我點擊“接受”並沒有顯示圖表，點擊“概述”、“數據實驗室”或“預覽”中的任何一個都沒有用。我被卡住了，根據本教程， ...

如何在 Gephi 中按屬性過濾邊緣？

[英]How to filter edges by attributes in Gephi?

我有一些帶有相應標簽的邊緣，我只想過濾帶有 label 1 的記錄，但它只是不起作用，如下所示。 function 用於過濾節點，但不適用於邊緣。我以為是邊緣太多的緣故，然后我嘗試了只有數百個邊緣的.gexf文件，但問題仍然存在。我還嘗試在應用程序中創建一個新列或使用 .gexf 文件中的 ...

將networkx圖轉換為Gephi

[英]Converting networkx graph to Gephi

我正在嘗試將 Python networkx圖轉換為 Gephi 兼容文件。但是，我遇到了一些我不明白如何解決的問題：問題：我們如何將節點特征向量合並到 gexf 文件中？我不斷收到錯誤消息：“TypeError：不允許使用屬性值類型：<class 'numpy.ndarray'&g ...

在 Gephi 中導出不會保留標簽 colors

[英]Exporting in Gephi doesn't keep labels colors

When I export my graph in PDF or SVG (in gephi 0.9.2, linux version), the nodes labels colors I've set are not kept (it's white or black). 奇怪的是，節點co ...

中心性可視化圖

[英]Visualization graph by centralities

我計算了 python igraph 中節點的中介中心性，並將其保存在 csv 文件中。現在我想通過中心點在 python 和 igraph 庫或 gephi 中看到它。我該怎么做？ ...

對有向圖的鄰接表進行 5 次隨機更改

[英]Making 5 random changes to an adjacency list for a directed graph

是否有一種自動方法可以從現有的鄰接列表中刪除 5 條邊，同時添加 5 條將現有節點連接到列表的新隨機邊？這意味着刪除的邊將被隨機邊替換。或者，我認為如果程序從列表中隨機刪除 5 個邊並將其保存為新文件，它也可以工作。也許，然后，我可以使用圖生成器來創建具有 5 個邊的隨機鄰接列表，例如，這些 ...

gephi 找不到 java 1.8 或更高版本的 JDK 16

[英]gephi cannot find java 1.8 or higher with JDK 16

我已經安裝了 JDK 16.0.1（文件夾 C:\Program Files\Java）並嘗試運行 Gephi，但出現錯誤“找不到 java 1.8 或更高版本”所以我搜索了如何解決這個問題，每個答案都涉及做一些事情與 JRE 目錄，所以我安裝了 JRE 8u291，它安裝在與 JDK 相同的文件 ...

使用 networkx 從 gephi 導入的圖形中獲取模塊化類

[英]Get modularity class from gephi imported graph using networkx

我已經從 Gephi 導入了一個 graphml 到 NetworkX。 G = nx.read_graphml(r"pah\\EXPORTCM0606.graphml") 在 Gephi 中，我計算了獲得 6 個主要社區的模塊化類，我想現在在 NetworkX 中獲取這些社區，以便獲得他們推文 ...

為 Gephi 運行 Maven

[英]Running Maven for Gephi

我想為 Gephi 創建一個插件，但在運行 Maven 時出現錯誤，並且該項目自 4 年以來不受支持......我已經將我的問題作為問題發布，但我認為現在沒有人會回答我。我分叉了 git 並嘗試按照README中的說明創建自己的插件，但是當我運行此命令時：我不斷收到此錯誤： [錯誤 ...

如何解決 Gephi 錯誤：甚至無法加載默認布局（安裝步驟）

[英]How to solve Gephi error : cannot load even default layout (Installation step)

我想問一下gephi，因為gephi程序不起作用。我已經下載了 Geph 0.9.2 版本和 Java JDK-16.0.1。如果我在下載后運行 Gephi，它會在彈出錯誤消息后很快啟動程序。 1. 使用內部預定義的配置，甚至無法加載默認布局 2.無法加載window系統持久化數據，用戶目錄 ...