R-稀疏2D數據的熱圖

Question

我想在不使用ggplot的情況下實現此人的目標。 有任何想法嗎？

如何在R中創建2D散射數據的連續密度熱圖？

您可以看到使用該問題中詳細介紹的解決方案時得到的信息。

ggplot(df,aes(x=x,y=y))+
  stat_density2d(aes(alpha=..level..), geom="polygon") +
  scale_alpha_continuous(limits=c(0,1),breaks=seq(0,1,by=0.1))+
  geom_point(colour="red",alpha=0.2)+
  theme_bw()

熱圖非常稀疏。 我希望它涵蓋的范圍遠遠超過現在的范圍。 很難看到有關密度的任何信息。 除了此ggplot解決方案以外，還有其他任何想法可從2D數據制作密度熱圖嗎？

我的一個想法是使用對數刻度進行密度標記，而不是使用線性顏色標記（請參見左側的黑白光譜，這是線性的）。 有什么想法可以做到嗎？

Answer 1

“熱圖是如此稀疏。我希望它能覆蓋的范圍遠遠超過現在所覆蓋的范圍。很難看到有關密度的任何信息。”

請具體說明：您想在擁有大多數或所有NA的區域看到什么？

• 如果您將geom_point與alpha-blending和position_jitter一起使用，則當前繪圖效果將與
• 如果是純色，則使用geom_hex（），請參見http://mfcovington.github.io/r_club/solutions/2013/02/28/peer-produced-plots-solutions/獲取代碼。 然后使用連續的color_scale ...您可能需要非線性變換。 如果您需要批評，請向我們發布您的修改嘗試。

Answer 2

我實際上最終使用了smoothScatter，它運作良好並且使用了經典的R繪圖。