將格式化數據讀入R中

Question

我正在嘗試使用stdin將數據讀入R.我想以下列格式讀取數據：

5       #rows matrix A
7       #cols matrix A
0 1 2 3 4 5 6
7 8 9 10 11 12 13
14 15 16 17 18 19 20
21 22 23 24 25 26 27
28 29 30 31 32 33 34
3       #rows matrix B
4       #cols matrix B
0 1 2 3
4 5 6 7
8 9 10 11
100     #param1
-7      #param2
9       #param3

我想如何讀取數據的示例最好通過以下c代碼舉例說明：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int* readMatrix(int rows, int cols) {
    int* matrix = (int*) malloc(rows*cols*sizeof(int));
    for (int i = 0; i < rows*cols; ++i) {
        scanf("%d", &matrix[i]);
    }
    return matrix;
}

int main() {
    int a_rows, a_cols; 
    int b_rows, b_cols;
    int *a, *b;
    int param1, param2, param3;

    scanf("%d %d", &a_rows, &a_cols);
    a = readMatrix(a_rows, a_cols);

    scanf("%d %d", &b_rows, &b_cols);
    b = readMatrix(b_rows, b_cols);

    scanf("%d %d %d", &param1, &param2, &param3);

    return 0;
}

我的“等效”R代碼是這樣的：

a_rows <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
a_cols <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
A <- matrix(scan(file="stdin", n = a_rows*a_cols), a_rows, a_cols, byrow = TRUE)

b_rows <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
b_cols <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
B <- matrix(scan(file="stdin", n = b_rows*b_cols), b_rows, b_cols, byrow = TRUE)

param1 <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
param2 <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
param3 <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);

當然，這不起作用，當我運行R腳本時，我得到以下輸出：

Read 1 item
Read 0 items
Read 0 items
Error in matrix(scan(file = "stdin", n = a_rows * a_cols), a_rows, a_cols,  :
  invalid 'ncol' value (too large or NA)
Execution halted

事實上，如果我嘗試只讀取前兩個值：

a_rows <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);
a_cols <- scan(file="stdin", what=integer(0), n=1);

我得到以下輸出：

Read 1 item
Read 0 items

有沒有人有這個問題的好解決方案？ 我一直試圖找到有關scan功能的更多信息，但無法找到有關我為什么會出現此行為的任何信息。

編輯1我正在運行R版本3.1.0

R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

編輯2我找到了解決方案，R代碼如下：

sin <- file("stdin");
open(sin);

a_rows <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
a_cols <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
A <- matrix(scan(sin, n = a_rows*a_cols), a_rows, a_cols, byrow = TRUE)

b_rows <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
b_cols <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
B <- matrix(scan(sin, n = b_rows*b_cols), b_rows, b_cols, byrow = TRUE)

param1 <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
param2 <- scan(sin, what=integer(0), n=1);
param3 <- scan(sin, what=integer(0), n=1);

為什么我要打開stdin ，我不知道。

Answer 1

我對您的代碼進行了三處小修改，然后就可以了：

1. 使用nlines=...而不是n=...
2. 使用file=stdin()而不是file="stdin"
3. 使用what=integer()而不是what=integer(0)

注意：我懷疑只有nlines=...在這里很重要。 其他變化可能沒有必要。

嘗試這個：

a_rows <- scan(file=stdin(), what=integer(), nlines=1);
a_cols <- scan(file=stdin(), what=integer(), nlines=1);
A <- matrix(scan(file=stdin(), nlines = a_rows), a_rows, a_cols, byrow = TRUE)
print(A)

然后我來源文件：

> source('~/.active-rstudio-document')
1: 2
Read 1 item
1: 3
Read 1 item
1: 1
2: 2
Read 2 items
> source('~/.active-rstudio-document')
1: 2
Read 1 item
1: 3
Read 1 item
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4: 4 5 6
Read 6 items
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