如何從python中捕獲matlab函數的輸出

Question

我正在運行下面的python代碼來評估數組的意思：

def matlab_func1(array):
    p = os.popen('matlab -nodesktop -nosplash  -r "mean('+str(array)+');exit"')
    while 1:
        line = p.readline()
        if not line:
            break
        print line

matlab_func1([1,2,3]) 

從下面的matlab腳本中，可以看到輸出返回y。 我想從python中捕獲此輸出。

function y = mean(x,dim)
...
...
end

該解決方案必須適用於其他matlab功能。 “均值”函數只是一個例子。

Answer 1

使用fprintf將所需的文本寫入stderr 。 只需在開頭添加一個額外的參數2 。

import subprocess
import os
def matlab_func1(array):
    p = subprocess.Popen(['/home/user/Matlab/bin/matlab', '-nodesktop', '-nosplash', '-r "m = mean(' + str(array) + ');fprintf(2, \'%d\\n\',m);exit" >/dev/null'], stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
    while 1:
        try:
            out, err = p.communicate()
        except ValueError:
            break
        print 'hello' + err

matlab_func1('[1,2,3]') 

有幾點需要注意：

• 將Python命令更改為subprocess.Popen ，它允許stderr管道。
• 在Matlab命令中，使用fprintf將想要的信息寫入stderr 。 這可以將代碼輸出與Matlab的標題行分開。
• 回到Python，使用Popen.communicate()來捕獲stderr輸出。
• 異常ValueError處理Matlab的退出事件（ p已關閉）。

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編輯：

用於提供多個輸出的功能

說一個Matlab函數是

function [y, z] = foo(x)
    y = x+1;
    z = x*20;
end

關鍵是使用fprintf來拋出輸出，同時像在Matlab中一樣正常地執行所有其他操作。

方法1 - 內聯腳本

p = subprocess.Popen(['/home/user/Matlab/bin/matlab', '-nodesktop', '-nosplash', '-r "[y, z] = foo(' + str(array) + ');for ii=1:length(y) fprintf(2, \'%d %d\\n\',y(ii),z(ii)); end; exit" >/dev/null'], stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)

方法2 - 獨立腳本

首先創建一個新的caller.m腳本

[y, z] = foo(x);
for ii=1:length(y)
    fprintf(2, '%d %d\n',y(ii),z(ii));
end

注意，從Python調用時要分配x ; 腳本共享相同的堆棧。 （切記不要在調用者腳本中clear工作區。）

然后，從Python調用腳本

p = subprocess.Popen(['/home/user/Matlab/bin/matlab', '-nodesktop', '-nosplash', '-r "x=' + str(array) + ';caller; exit" >/dev/null'], stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)

將Matlab存儲在Python變量中

• 通過stdout / stderr管道傳遞數據時：

  請參閱this和subprocess.check_output() 。

• 處理double或二進制等嚴重數據時：

  使用Matlab將數據寫入外部文件。 然后用Python讀取這個文件。 應該定義一個雙方互相交談的協議。