使用gdcm（草根DICOM）解壓縮DICOM圖像數據

Question

是否可以將Python包裝器用於GDCM來解碼DICOM文件中的圖像數據？

我有一個byte array / string ，其中包含DICOM文件中圖像數據的bytes （即標記7fe0,0010 （“像素數據”）的內容），並且我想將圖像解碼為原始RGB或灰度。

我正在考慮一些類似的方法，但是僅使用圖像數據，而不是實際DICOM文件本身的路徑。

Answer 1

您可以閱讀示例，其中有一個示例說明了如何將輸入的壓縮DICOM轉換為未壓縮的DICOM。 在此處在線查看代碼：

• 解壓縮圖像

如果您是NumPy的忠實粉絲，請查看：

• 此模塊添加了將gdcm.Image轉換為numpy數組的支持。

這是一個較低級別的示例，它顯示了如何檢索圖像的實際原始緩沖區。

處理Transfer Syntax轉換的更好的類是使用gdcm.ImageChangeTransferSyntax類（允許對圖標進行解壓縮）

• gdcm :: ImageChangeTransferSyntax類參考

如果您不介意閱讀一點C ++，則可以將以下代碼從C ++輕松轉換為Python：

• 壓縮影像

請注意，此示例實際上是在壓縮圖像而不是對其進行解壓縮 。

最后，如果您真的只能訪問Pixel Data屬性中包含的數據值，那么您應該真正看看（C＃語法應與Python語法接近）：

• 解壓縮JPEG文件

此示例說明了如何解壓縮JPEG無損，非分層，一階預測文件。 JPEG數據是從文件中讀取的，但如果您的情況下該數據已在內存中，則它應該可以工作。