使用gdcm（草根DICOM）解压缩DICOM图像数据

Question

是否可以将Python包装器用于GDCM来解码DICOM文件中的图像数据？

我有一个byte array / string ，其中包含DICOM文件中图像数据的bytes （即标记7fe0,0010 （“像素数据”）的内容），并且我想将图像解码为原始RGB或灰度。

我正在考虑一些类似的方法，但是仅使用图像数据，而不是实际DICOM文件本身的路径。

Answer 1

您可以阅读示例，其中有一个示例说明了如何将输入的压缩DICOM转换为未压缩的DICOM。 在此处在线查看代码：

• 解压缩图像

如果您是NumPy的忠实粉丝，请查看：

• 此模块添加了将gdcm.Image转换为numpy数组的支持。

这是一个较低级别的示例，它显示了如何检索图像的实际原始缓冲区。

处理Transfer Syntax转换的更好的类是使用gdcm.ImageChangeTransferSyntax类（允许对图标进行解压缩）

• gdcm :: ImageChangeTransferSyntax类参考

如果您不介意阅读一点C ++，则可以将以下代码从C ++轻松转换为Python：

• 压缩影像

请注意，此示例实际上是在压缩图像而不是对其进行解压缩 。

最后，如果您真的只能访问Pixel Data属性中包含的数据值，那么您应该真正看看（C＃语法应与Python语法接近）：

• 解压缩JPEG文件

此示例说明了如何解压缩JPEG无损，非分层，一阶预测文件。 JPEG数据是从文件中读取的，但如果您的情况下该数据已在内存中，则它应该可以工作。