OS X Yosemite 上 R 中的 gfortran 4.8 錯誤

Question

過去幾個月我一直在 Linux 機器上使用這個 R 包進行單細胞分析 (SCDE) ，沒有任何問題。

不過，讓它在我的 Mac 上運行時遇到了很多麻煩。 在 Mavericks 上安裝似乎工作正常，但我已經在兩台裝有 Yosemite 的 Mac 上嘗試過，但無濟於事。

問題似乎在於gfortran 4.8與 Yosemite 不兼容； 我收到此錯誤：

gfortran-4.8   -fPIC  -g -O2  -c dqrdc.f -o dqrdc.o
gfortran-4.8: warning: couldn’t understand kern.osversion ‘14.1.1

許多人在嘗試在 R 之外使用gfortran在 Yosemite 上遇到此錯誤，他們找到的解決方案是升級到gfortran 5.0 ，該版本已被修復以與 Yosemite 配合使用。

但是，R 調用了特定版本的gfortran (4.8) ，所以我有點卡在這里。 我無法真正升級到gfortran 5.0因為 R 無法識別它，而且gfortran 4.8不能很好地與我的操作系統配合使用。

任何幫助將非常感激。

Answer 1

如果你有 Homebrew，你可以像這樣安裝 gcc/gfortran 4.8 和新的 gfortran：

brew install gcc48 --with-fortran

此處更詳細地討論了相同的問題： OS X 軟件包安裝取決於 gfortran-4.8