OS X Yosemite 上 R 中的 gfortran 4.8 错误

Question

过去几个月我一直在 Linux 机器上使用这个 R 包进行单细胞分析 (SCDE) ，没有任何问题。

不过，让它在我的 Mac 上运行时遇到了很多麻烦。 在 Mavericks 上安装似乎工作正常，但我已经在两台装有 Yosemite 的 Mac 上尝试过，但无济于事。

问题似乎在于gfortran 4.8与 Yosemite 不兼容； 我收到此错误：

gfortran-4.8   -fPIC  -g -O2  -c dqrdc.f -o dqrdc.o
gfortran-4.8: warning: couldn’t understand kern.osversion ‘14.1.1

许多人在尝试在 R 之外使用gfortran在 Yosemite 上遇到此错误，他们找到的解决方案是升级到gfortran 5.0 ，该版本已被修复以与 Yosemite 配合使用。

但是，R 调用了特定版本的gfortran (4.8) ，所以我有点卡在这里。 我无法真正升级到gfortran 5.0因为 R 无法识别它，而且gfortran 4.8不能很好地与我的操作系统配合使用。

任何帮助将非常感激。

Answer 1

如果你有 Homebrew，你可以像这样安装 gcc/gfortran 4.8 和新的 gfortran：

brew install gcc48 --with-fortran

此处更详细地讨论了相同的问题： OS X 软件包安装取决于 gfortran-4.8