R在同一圖中繪制多條生存曲線

Question

我試圖在同一個圖中繪制多條生存曲線。 使用plot我可以很容易地做到這一點

plot(sr_fit_0, col = 'red' , conf.int=TRUE, xlim=c(0, max_m))
par(new=TRUE)
plot(sr_fit_1,  col ='blue', conf.int=TRUE, xlim=c(0, max_m))`

但是現在我想使用ggsurv繪制生存曲線，我不知道如何在同一個圖中使用它們（不是子圖）。 任何幫助表示贊賞。

Answer 1

為了倉鼠和沙鼠的生命，我在下面生成了一些數據。 您可以使用類似於其他曲線擬合函數的survfit（）函數，並定義一個分割總體的數據框列。 當您使用ggsurv（）創建繪圖時，我認為它將顯示您要查找的內容。

## Make some data for varmint life
set.seed(1); l1 <- rnorm(120, 2.5, 1)
gerbils <- data.frame(life = l1[l1>0])
set.seed(3); l2 <- rnorm(120, 3, 1)
hamsters <- data.frame(life = l2[l2>0])

## Load required packages
require('survival'); require('GGally')

## Generate fits for survival curves
## (Note that Surv(x) creates a Survival Object)
sf.gerbils <- survfit(Surv(life) ~ 1, data = gerbils)
sf.hamsters <- survfit(Surv(life) ~ 1, data = hamsters)
ggsurv(sf.gerbils) #Survival plot for gerbils
ggsurv(sf.hamsters) #Survival plot for hamsters

## Combine gerbils and hamsters while adding column for identification
varmints <- rbind((cbind(gerbils, type = 'gerbil')),
                  (cbind(hamsters, type = 'hamster')))

## Generate survival for fit for all varmints as a function of type
sf.varmints <- survfit(Surv(life) ~ type, data = varmints)

## Plot the survival curves on one chart
ggsurv(sf.varmints)