找不到shapeit命令-用於GWAS移相的shapeit安裝

Question

我想安裝用於Shape的GWAS移相和歸納。 我從Shapeit網站下載了macOS的Shapeit版本：

https://mathgen.stats.ox.ac.uk/genetics_software/shapeit/shapeit.html#download

我提取了文件，並得到了shapeit可執行文件，示例文件夾和許可文件。

接下來，我在Mac中打開終端，將目錄cd到shapeit文件夾，然后按照網站的指導輸入命令行：

shapeit -B gwas \
        -M genetic_map.txt \
        -O gwas.phased

我得到了回應：

shapeit command not found.

我想這意味着我需要安裝shapeit或為shapeit設置路徑。 但是我不知道該怎么辦。 我對Macos非常陌生。

有人可以幫我嗎？

Answer 1

1. 嘗試使用./shapeit代替shapeit ，或
2. 首先運行cp shapeit /usr/local/bin然后重試。