[英]R: Scatter plot matrix using ggplot2 with themes that vary by facet panel
我想使用ggplot2創建Scatter Plot Matrix。 部分我應對了我的問題。 我設法使用ggplot2創建三部分圖:下三角形 - Scatterplot,對角變量名稱和上三角形 - 相關系數(R ^ 2)。 下面我給出了我的數據+代碼生成我的圖表。 我的數據:
f =
C xval V yval corr V1
1 1622 1 1622 1 2ng
1 1622 2 1639 0.997 2ng
1 1622 3 1584 0.992 2ng
1 1622 4 1549 0.99 2ng
1 1622 5 1541 0.993 2ng
1 1622 6 1543 0.994 2ng
1 1622 7 1530 0.988 2ng
2 1639 1 1622 0.997 5ng
2 1639 2 1639 1 5ng
2 1639 3 1584 0.997 5ng
2 1639 4 1549 0.997 5ng
2 1639 5 1541 0.998 5ng
2 1639 6 1543 0.998 5ng
2 1639 7 1530 0.995 5ng
3 1584 1 1622 0.992 10ng
3 1584 2 1639 0.997 10ng
3 1584 3 1584 1 10ng
3 1584 4 1549 0.997 10ng
3 1584 5 1541 0.995 10ng
3 1584 6 1543 0.999 10ng
3 1584 7 1530 0.999 10ng
4 1549 1 1622 0.99 15ng
4 1549 2 1639 0.997 15ng
4 1549 3 1584 0.997 15ng
4 1549 4 1549 1 15ng
4 1549 5 1541 0.998 15ng
4 1549 6 1543 0.998 15ng
4 1549 7 1530 0.998 15ng
5 1541 1 1622 0.993 30ng
5 1541 2 1639 0.998 30ng
5 1541 3 1584 0.995 30ng
5 1541 4 1549 0.998 30ng
5 1541 5 1541 1 30ng
5 1541 6 1543 0.998 30ng
5 1541 7 1530 0.995 30ng
6 1543 1 1622 0.994 60ng
6 1543 2 1639 0.998 60ng
6 1543 3 1584 0.999 60ng
6 1543 4 1549 0.998 60ng
6 1543 5 1541 0.998 60ng
6 1543 6 1543 1 60ng
6 1543 7 1530 0.998 60ng
7 1530 1 1622 0.988 100ng
7 1530 2 1639 0.995 100ng
7 1530 3 1584 0.999 100ng
7 1530 4 1549 0.998 100ng
7 1530 5 1541 0.995 100ng
7 1530 6 1543 0.998 100ng
7 1530 7 1530 1 100ng
和代碼:
g <- ggplot(data = f, aes(x=xval, y=yval))+
geom_point(data = f[(xtfrm(f$C)<xtfrm(f$V)),], colour = "darkblue", size = 1.5)+
geom_smooth(data = f[(xtfrm(f$C)<xtfrm(f$V)),], aes(colour = "red"), method="lm", size = 0.1)+
geom_text(data = f[(xtfrm(f$C)==xtfrm(f$V)),], aes(x = 4000, y = 4000, label = paste(V1)), size = 10, colour="red")+
geom_tile(aes(fill=corr))+
geom_text(data = f[(xtfrm(f$C)>xtfrm(f$V)), ], aes(x = 4000, y = 4000, label = corr), size = 10)+
coord_cartesian(xlim=c(0,8000), ylim=c(0,8000))+
facet_grid(V~C, space = "fixed") +
theme(panel.grid.major = element_blank(), strip.background = element_blank(), strip.text.y = element_blank(), strip.text.x = element_blank(), legend.position = "none")
g
但是,我遇到了改善圖形外觀的問題。 我想用不同的背景顏色分離圖形的一部分,例如:散射的白色背景,變量名稱的灰色和相關系數的藍色。 有誰知道怎么做? 是否可以或者我必須單獨創建圖的每個部分?
一種方法是分別創建每個圖,然后將它們放在一起。 這允許您為每個繪圖獨立設置所有繪圖元素,包括主題元素,如背景填充顏色。
下面的函數使用mapply
為V
和C
每個組合創建一個單獨的圖,並使用if
語句為每個圖分配所需的背景顏色。
library(gridExtra)
p.list = mapply(FUN=function(v,c) {
fvc = f[f$V==v & f$C==c, ]
g <- ggplot(data=fvc, aes(x=xval, y=yval))+
coord_cartesian(xlim=c(0,8000), ylim=c(0,8000))+
theme(axis.title=element_blank(),
axis.text=element_text(size=8))
if (c == v) {
g = g + geom_text(aes(x = 4000, y = 4000, label=V1),
size = 6, colour="red")
}
if (c < v) {
g = g + geom_text(aes(x = 4000, y = 4000, label=corr), size = 6) +
theme(panel.background=element_rect(fill=hcl(180,100,60, alpha=0.3)))
}
if (c > v) {
g = g + geom_point(colour = "darkblue", size = 1.5) +
geom_smooth(aes(colour = "red"), method="lm", size = 0.1) +
theme(panel.background=element_blank(),
panel.grid.major=element_line(colour="grey80", size=0.3))
}
if(v != 1) {
g = g + theme(axis.text.y=element_blank(),
axis.ticks.y=element_blank())
}
if(c != max(f$C)) {
g = g + theme(axis.text.x=element_blank(),
axis.ticks.x=element_blank())
}
return(g) },
expand.grid(V=unique(f$V), C=unique(f$C))[[1]],
expand.grid(V=unique(f$V), C=unique(f$C))[[2]], SIMPLIFY=FALSE)
現在將所有圖表一起布局並添加x軸和y軸標簽:
grid.arrange(
arrangeGrob(
arrangeGrob(textGrob("Y vals", rot=90),
do.call(arrangeGrob, c(p.list, ncol=7)), widths=c(0.05,0.95)),
textGrob("X vals"), heights=c(0.95,0.05)))
正如您在上圖中所看到的,還有一個問題:由於軸標簽,第一列和最后一行中的面板具有較小的繪圖區域。 這個SO答案顯示了如何均衡繪圖區域的大小,但您必須分別列出每個繪圖對象。
幸運的是,我們沒有推出自己的功能,以平衡所有的繪圖區域的大小,大格地塊,作為plot_grid
從cowplot
包,能做到這一點。 但是,在運行plot_grid
之后,我認為每個圖之間的邊距太大了。 您可以通過在創建圖形時更改繪圖邊距來調整此值。 為此,您可以在繪圖函數的return
行中調整繪圖邊距,如下所示:
return(g + theme(plot.margin=unit(c(0,-0.15,0,-0.15), "lines"))) },
然后使用plot_grid
:
library(cowplot)
grid.arrange(
arrangeGrob(
arrangeGrob(textGrob("Y vals", rot=90),
do.call(plot_grid, c(p.list, align="hv")), widths=c(0.05,0.95)),
textGrob("X vals"), heights=c(0.95,0.05)))
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