R - 僅保留列名與字符串匹配的列

Question

我對 R 比較陌生，我很幸運在這里找到了答案，但是在嘗試了 2 天之后，這個問題讓我難倒了。

我有一個列名的數據框，如下所示：

TargetID sample1.beta sample1.avg sample1.error sample1.pval sample2.beta sample2.avg sample2.error sample2.pval

這對數千個樣本重復。 我需要為每條數據創建多個單獨的數據框：一個用於 beta，一個用於 avg，一個用於錯誤，一個用於 pval。 我還需要在所有數據框中保留帶有 TargetID 的第一列。 生成的數據框將具有如下列名：

TargetID sample1.beta sample2.beta sample3.beta

目標ID sample1.pval sample2.pval sample3.pval

等。

我找到了對數據框進行子集化的答案，但它們似乎不適用於選擇包含特定字符串的所有列（並保留第一列）。

在使用 awk 導入到 R 之前，我也一直在探索使用 txt 文件是否更好地完成此操作。

Answer 1

在 "[" 的第二個位置使用grepl或grep ，其模式包含TargetID和應用於names(dfrm_name)的子集字符串：

 avg_sub <- dfrm[ , grepl( "^TargetID|avg$", names(dfrm) ]

“^”模式匹配字符串的開頭，而“$”模式匹配字符串的結尾。

Answer 2

您可以嘗試（因為您不使用mtcars提供示例數據）：

library(dplyr)
# select the column mpg and all the columns containing an r
head(mtcars %>% select(mpg, contains("r")))
                   mpg drat gear carb
Mazda RX4         21.0 3.90    4    4
Mazda RX4 Wag     21.0 3.90    4    4
Datsun 710        22.8 3.85    4    1
Hornet 4 Drive    21.4 3.08    3    1
Hornet Sportabout 18.7 3.15    3    2
Valiant           18.1 2.76    3    1