使用numpy讀取二進制文件中的幾個數組

Question

我正在嘗試讀取一個二進制文件，該文件由幾個由單個int分隔的浮點數矩陣組成。 Matlab中實現此目的的代碼如下：

fid1=fopen(fname1,'r');
for i=1:xx
    Rstart= fread(fid1,1,'int32');        #read blank at the begining
    ZZ1 = fread(fid1,[Nx Ny],'real*4');   #read z
    Rend  = fread(fid1,1,'int32');        #read blank at the end
end

如您所見，每個矩陣大小為Nx x Ny。 Rstart和Rend只是偽值。 ZZ1是我感興趣的矩陣。

我正在嘗試在python中做同樣的事情，執行以下操作：

Rstart = np.fromfile(fname1,dtype='int32',count=1)
ZZ1 = np.fromfile(fname1,dtype='float32',count=Ny1*Nx1).reshape(Ny1,Nx1)
Rend = np.fromfile(fname1,dtype='int32',count=1)

然后，我必須進行迭代以讀取后續矩陣，但是函數np.fromfile不會在文件中保留指針。

另外一個選項：

with open(fname1,'r') as f:
   ZZ1=np.memmap(f, dtype='float32', mode='r', offset = 4,shape=(Ny1,Nx1))
   plt.pcolor(ZZ1)

這對於第一個數組工作正常，但不會讀取下一個矩陣。 知道我該怎么做嗎？

我搜索了類似的問題，但沒有找到合適的答案。

謝謝

Answer 1

在單個矢量化語句中讀取所有矩陣的最干凈方法是使用struct數組：

dtype = [('start', np.int32), ('ZZ', np.float32, (Ny1, Nx1)), ('end', np.int32)]
with open(fname1, 'rb') as fh:
    data = np.fromfile(fh, dtype)
print(data['ZZ'])

Answer 2

有兩種解決方案。

第一個：

for i in range(x):
    ZZ1=np.memmap(fname1, dtype='float32', mode='r', offset = 4+8*i+(Nx1*Ny1)*4*i,shape=(Ny1,Nx1))

我在哪里是你想得到的數組。

第二個：

fid=open('fname','rb')
for i in range(x):
    Rstart = np.fromfile(fid,dtype='int32',count=1)
    ZZ1 = np.fromfile(fid,dtype='float32',count=Ny1*Nx1).reshape(Ny1,Nx1)
    Rend = np.fromfile(fid,dtype='int32',count=1)

因此，正如Morningsun指出的那樣，np.fromfile可以接收文件對象作為參數並跟蹤指針。 請注意，您必須以二進制模式“ rb”打開文件。