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如何在R中的GLM上執行類似TukeyHSD的測試?

[英]How do I perform a TukeyHSD like test on a GLM in R?

我正在嘗試分析我在R中創建的glm,我想要做的是成對比較我的哪些因素與Anovas的TukeyHSD測試類似,彼此之間有顯着差異。 但是,有人告訴我TukeyHSD不適用於GLM。 經過研究后,我發現了兩個選項,但我不確定哪個是正確的或適用的是glht或對比度命令。

這是GLM的代碼。

glm.mod <- glm(as.numeric(Ostra..Avg.body.size) ~ as.factor(Macrophytes)*as.factor(Leaves)*as.factor(MacrophyteintLeaves) = 'gaussian', data = main)

我希望根據我的大型植物的因素(即是否存在大型植物的種類,可以選擇不適用,不適用C或E的選項)來更改體型變量。 並且葉子具有不帶q1,q2的三個選項

這是我的數據看起來像的一個例子(包含值)

Macrophyte  Leaves  Animals CODE    Ostra. Avg body size
Without     Q1        N       1     11000
E           Q2        Y         2   11853
C           without     N     3     13422
Without     Q1          Y     4     13838

例如,如何獲得顯示效果的輸出

沒有大型植物Q1葉子-沒有大型植物Q2葉子(然后是一個值,表示它們彼此之間是否存在顯着差異,例如ap值)。

任何幫助將不勝感激,並在此先感謝。如果有任何重要的信息我錯過了,請告訴我。

具有一個數字響應變量和一個(或幾個)分類預測變量,我通常將使用以下函數對每個主要效應(例如,僅大型植物;僅葉片)和相互作用效應進行顯着性的成對比較:

TukeyHDS(aov(as.numeric(Ostra..Avg.body.size) ~ as.factor(Macrophytes)*as.factor(Leaves)*as.factor(MacrophyteintLeaves)

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