[英]How do I perform a TukeyHSD like test on a GLM in R?
我正在嘗試分析我在R中創建的glm,我想要做的是成對比較我的哪些因素與Anovas的TukeyHSD測試類似,彼此之間有顯着差異。 但是,有人告訴我TukeyHSD不適用於GLM。 經過研究后,我發現了兩個選項,但我不確定哪個是正確的或適用的是glht或對比度命令。
這是GLM的代碼。
glm.mod <- glm(as.numeric(Ostra..Avg.body.size) ~ as.factor(Macrophytes)*as.factor(Leaves)*as.factor(MacrophyteintLeaves) = 'gaussian', data = main)
我希望根據我的大型植物的因素(即是否存在大型植物的種類,可以選擇不適用,不適用C或E的選項)來更改體型變量。 並且葉子具有不帶q1,q2的三個選項
這是我的數據看起來像的一個例子(包含值)
Macrophyte Leaves Animals CODE Ostra. Avg body size
Without Q1 N 1 11000
E Q2 Y 2 11853
C without N 3 13422
Without Q1 Y 4 13838
例如,如何獲得顯示效果的輸出
沒有大型植物Q1葉子-沒有大型植物Q2葉子(然后是一個值,表示它們彼此之間是否存在顯着差異,例如ap值)。
任何幫助將不勝感激,並在此先感謝。如果有任何重要的信息我錯過了,請告訴我。
具有一個數字響應變量和一個(或幾個)分類預測變量,我通常將使用以下函數對每個主要效應(例如,僅大型植物;僅葉片)和相互作用效應進行顯着性的成對比較:
TukeyHDS(aov(as.numeric(Ostra..Avg.body.size) ~ as.factor(Macrophytes)*as.factor(Leaves)*as.factor(MacrophyteintLeaves)
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