在 H5PY 中打開文件時出錯（未找到文件簽名）

Question

我一直在使用以下代碼打開一些 HDF5 文件，這些文件在 MATLAB 中使用 H5PY 在 python 中生成：

import h5py as h5
data='dataset.mat'
f=h5.File(data, 'r')

但是我收到以下錯誤：

OSError: Unable to open file (File signature not found)

我檢查了我要打開的文件是 7.3 版的 MAT 文件，並且是 HDF5 格式。 事實上，我之前已經使用 H5PY 成功打開過相同的文件。 我已經確認這些文件存在並且可以訪問，所以我不確定錯誤來自哪里。 任何建議將不勝感激，在此先感謝：）

Answer 1

通常消息File signature not found表明：

1.您的文件已損壞。

……我覺得最有可能。 你說你以前打開過這些文件。 也許您忘記關閉可能損壞文件的文件句柄。 嘗試使用 HDF5 實用程序h5debug檢查文件（如果您在操作系統上安裝了 hdf5 lib，則可以在命令行上使用，在 Linux 上使用dpkg -s libhdf5-dev檢查）。

2. 文件不是 HDF5 格式。

這是您的錯誤消息的已知原因。 但是既然你說你確定了，就是這種情況並且你以前打開過文件，我提供這個僅供參考，供其他可能在這里絆倒的人參考：

自 2015 年 12 月（從 7.3 版開始），Matlab 文件在其MAT 文件級別 5 容器中使用基於 HDF5 的格式（更多文檔）。 scipy庫支持早期版本的 MAT 文件（v4（1.0 級）、v6 和 v7 到 7.2）並可使用scipy庫讀取：

import scipy.io
f = scipy.io.loadmat('dataset.mat')

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否則您可以嘗試其他方法並查看錯誤是否仍然存在：

PyTables是h5py的替代品，可在此處找到。

import tables
file = tables.open_file('test.mat')

安裝使用

pip install tables

如果您安裝了 matlab， Python MATLAB 引擎是讀取 MAT 文件的替代方法。 文檔位於此處： MATLAB Engine API for Python 。

import matlab.engine
mat = matlab.engine.start_matlab()
f = mat.load("dataset.mat", nargout=1)

Answer 2

我的 .h5 文件也面臨同樣的問題。 問題是我沒有正確下載 .h5 文件。

我正在做 filename.h5->right_click->save link as，它沒有正確下載文件（或者可能是文件被損壞了）。 我沒有這樣做，而是將文件下載為：選擇帶有 filename.h5 的復選框，然后單擊下載，然后我的代碼就可以工作了。

可能這有助於那些犯同樣錯誤的人。

Answer 3

通常這發生在文件損壞時。 我遇到了這個問題並再次下載了文件，它解決了問題。

Answer 4

如果有人在 Jupyter 中遇到此問題，您只需單擊文件的復選框，然后單擊下載按鈕。
我從 這里得到的這個解決方案幫助了我，希望它會幫助你們。

Answer 5

使用tar -czvf zipfilename.tar.gz weightsfile壓縮文件對我tar -czvf zipfilename.tar.gz weightsfile 。