[英]R dplyr - rollmean using group by columns
我有一個數據框如下:
(如果數據不符合格式,請查找圖像)
Sample Data
date id name loc mean count mean
9/6/2016 kar1 AAA 100004 0 1
9/8/2016 kar1 AAA 100004 0 3
9/9/2016 kar1 AAA 100004 0 4
9/10/2016 kar1 AAA 100004 0 5
9/11/2016 kar1 AAA 100004 0 6
9/12/2016 kar1 AAA 100004 0 7
9/13/2016 kar1 AAA 100004 0 8
9/14/2016 kar1 AAA 100004 0 9
9/7/2016 blr1 BBB 100004 0 2
我正在嘗試根據 id、name、loc 在計數字段上計算((7 天滾動平均值))3 天滾動平均值(前 3 天和后 3 天),但結果不符合預期。
找到以下代碼:
fnrollmean <- function(x) rollmean(df$count,7,na.pad=TRUE,align="center")
rollmeandf <- df %>% group_by(id,name,loc) %>% arrange(id,name,loc) %>% mutate(funs=fnrollmean(df$count))
我得到錯誤:
eval(substitute(expr)、envir、enclos) 中的錯誤:大小不兼容 (9),需要 8(組大小)或 1
如果我只是這樣做:
test2 <- df %>% mutate(funs=fnrollmean(df$count))
它有效,但通過考慮所有錯誤的疾病進行計算。
如果遺漏了什么或任何解決方法,請告訴我。
預期成績:
date id name loc mean count mean
9/6/2016 kar1 AAA 100004 0 1 NA
9/8/2016 kar1 AAA 100004 0 3 NA
9/9/2016 kar1 AAA 100004 0 4 NA
9/10/2016 kar1 AAA 100004 0 5 4.8
9/11/2016 kar1 AAA 100004 0 6 6
9/12/2016 kar1 AAA 100004 0 7 NA
9/13/2016 kar1 AAA 100004 0 8 NA
9/14/2016 kar1 AAA 100004 0 9 NA
9/7/2016 blr1 BBB 100004 0 2 NA
謝謝
要使用mutate
,您必須有一個窗口函數,該函數返回與函數輸入的向量相同長度的向量(或返回一個標量,該標量將被強制轉換為填充了標量值的該長度的向量)。 問題是您的fnrollmean
沒有,因此出現錯誤。 請注意,即使在使用您發布的輸入數據遵循 jdobre 的評論后,相同類型的錯誤仍將存在,因為您的第二組(blr1, BBB, 100004)
只有1
行。 因此,將fnrollmean
修改為:
library(zoo)
fnrollmean <- function (x) {
if (length(x) < 7) {
rep(NA,length(x))
} else {
rollmean(x,7,align="center",na.pad=TRUE)
}
}
請注意,我們按照 jdobre 的注釋在函數中使用x
而不是df$count
。 然后(再次遵循 jdobre 的評論,在mutate
調用fnrollmean
時使用count
而不是df$count
):
library(dplyr)
result <- df %>% group_by(id,name,loc) %>%
mutate(rollavg=fnrollmean(count))
給出:
print(result)
##Source: local data frame [9 x 7]
##Groups: id, name, loc [2]
##
## date id name loc mean count rollavg
## <fctr> <fctr> <fctr> <int> <int> <int> <dbl>
##1 9/6/2016 kar1 AAA 100004 0 1 NA
##2 9/8/2016 kar1 AAA 100004 0 3 NA
##3 9/9/2016 kar1 AAA 100004 0 4 NA
##4 9/10/2016 kar1 AAA 100004 0 5 4.857143
##5 9/11/2016 kar1 AAA 100004 0 6 6.000000
##6 9/12/2016 kar1 AAA 100004 0 7 NA
##7 9/13/2016 kar1 AAA 100004 0 8 NA
##8 9/14/2016 kar1 AAA 100004 0 9 NA
##9 9/7/2016 blr1 BBB 100004 0 2 NA
聲明:本站的技術帖子網頁,遵循CC BY-SA 4.0協議,如果您需要轉載,請注明本站網址或者原文地址。任何問題請咨詢:yoyou2525@163.com.