使用python 2.7和regex使用子字符串的開頭和結尾（密碼子）查找子字符串

Question

（python 2.7）我有一個 RNA 序列，我試圖找到所有以“AUG”開頭並以“UAG”或“UGA”或“UAA”結尾的非重疊子串，這就是我正在使用的：

import re
sequence = GAUGCAAAAUAAAUGAUGUAAUAA
search = r"^(AUG(.)*(?:UAG|UAA|UGA))" 
regions = re.findall(search, sequence)
print regions

輸出應為“AUGCAAAA”和“AUGAUG”。 但是我得到了整個區域'AUGCAAAAUAAAUGAUGUAAUAA'

Answer 1

看起來你需要使用

AUG.*?(?=UAG|UAA|UGA)

看到這個正則表達式演示

詳情：

• AUG - 匹配AUG
• .*? - 除換行符以外的任何 0+ 個字符，在第一個之前盡可能少......
• (?=UAG|UAA|UGA) - UAG或UAA或UGA （它們不是返回值的一部分，因為該模式位於作為零寬度斷言的正前瞻內）。