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基於列總和的子集小標題,同時保留字符列

[英]Subset tibble based on column sums, while retaining character columns

我覺得這是一個非常愚蠢的問題,但我也無法找到解決方案

我有一個小標題,其中每一行都是一個樣本,第一列是一個包含樣本ID的字符變量,所有后續列都是帶有數字變量的變量。

例如:

id <- c("a", "b", "c", "d", "e")
x1 <- rep(1,5)
x2 <- seq(1,5,1)
x3 <- rep(2,5)    
x4 <- seq(0.1, 0.5, 0.1)
tb <- tibble(id, x1, x2, x3, x4) 

我想對此進行子集化,以僅包括總和大於5的列和id列。 使用舊的數據框結構,我知道以下工作方式:

df <- as.data.frame(tb)
df2 <- cbind(df$id, df[,colSums(df[,2:5])>5)
colnames(df2)[1] <- "id"

但是,當我嘗試以這種方式對子集進行細化時,出現錯誤消息:

Error: Length of logical index vector must be 1 or 5, got: 4

有誰知道如何在不轉換為舊數據幀格式的情況下完成此任務? 最好不要創建缺少id變量的中間小標題,因為將我的id與數據分開只是在路上麻煩。

謝謝!

# install.packages(c("tidyverse"), dependencies = TRUE)
library(tibble)
df <- tibble(id = letters[1:5], x1 = 1, x2 = 1:5, x3 = 2, x4 = seq(.1, .5, len = 5))
### two additional examples of how to generate the Tibble data
### exploiting that its arguments are evaluated lazily and sequentially
# df <- tibble(id = letters[1:5], x1 = 1, x2 = 1:5, x3 = x1 + 1, x4 = x2/10)
# df <- tibble(x2 = 1:5, id = letters[x2], x3 = 2, x1 = x3-1, x4 = x2/10) %>%
#              select(id, num_range("x", 1:4))

base R解決方案,請參閱。 HubertL的上述評論

###  HubertL's base solution
df[c(TRUE,colSums(df[2:5])>5)]
#> # A tibble: 5 x 3
#>      id    x2    x3
#>   <chr> <int> <dbl>
#> 1     a     1     2
#> 2     b     2     2
#> 3     c     3     2
#> 4     d     4     2
#> 5     e     5     2

dplyr解決方案,請dplyr David Klotz的評論

### Klotz's dplyr solution
library(dplyr)
df %>% select_if(function(x) is.character(x) || sum(x) > 5)
#> # A tibble: 5 x 3
#>      id    x2    x3
#>   <chr> <int> <dbl>
#> 1     a     1     2
#> 2     b     2     2
#> 3     c     3     2
#> 4     d     4     2
#> 5     e     5     2

暫無
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