如何從DICOM圖像的原始數據創建圖像

Question

我有來自DICOM圖像的byte[]的原始像素數據。 現在，我想將此byte[]轉換為Image對象。

我試過了：

Image img = Image.FromStream(new MemoryStream(byteArray));

但這對我不起作用。 我還應該使用什么？

Answer 1

要注意的一件事是，dicom“圖像”不一定只是圖像數據。 dicom文件格式包含的內容遠遠超出原始圖像數據。 這可能是您掛斷電話的地方。 考慮檢查dicom文件標准，您應該能夠在Wikipedia文章上找到dicom的鏈接。 這應該可以幫助您弄清楚如何解析您實際感興趣的信息。

Answer 2

您應該使用GDCM。

草根DiCoM是用於DICOM醫療文件的C ++庫。 它會自動包裝到python / C＃/ Java（使用swig）。 它支持RAW，JPEG 8/12/16位（有損/無損），JPEG 2000，JPEG-LS，RLE和放氣（zlib）。

它是可移植的，並且已知可以在大多數系統（Win32，Linux，MacOSX）上運行。

• http://gdcm.sourceforge.net/wiki/index.php/GDCM_Release_2.4

參見例如：

• http://gdcm.sourceforge.net/html/DecompressImage_8cs-example.html

Answer 3

像素數據通常（如果不是始終）以DICOM數據結尾。 如果您可以弄清楚寬度，高度，步幅和顏色深度，則應該可以跳到（7FE0,0010）數據元素值，而只是獲取后續字節。 這是大多數普通圖像查看器在顯示DICOM圖像時使用的技巧。

Answer 4

有一個名為EvilDicom（ http://rexcardan.com/evildicom/ ）的C＃庫，可用於將圖像從DICOM文件中拉出。 它在網站上提供了有關如何操作的教程。

Answer 5

您必須執行以下操作

1. 從文件中識別PIXEL DATA標簽。 您可以使用FileStream逐字節讀取。
2. 讀取像素數據
3. 轉換為RGB
4. 從RGB創建一個BitMap對象
5. 使用Graphics類在面板上繪制BitMap。

Answer 6

DICOM是一個荒謬的規范，我衷心希望它會在不久的將來得到徹底修改。 也就是說，Offis擁有一個軟件套件“ DCMTK”，該套件非常擅長用各種流行的編碼轉換dicom。 僅嘗試跳過文件的x字節可能對於單個文件來說會很好，但是如果您有一個或多個卷，則可以采用更可靠的策略。 我使用了DCMTK的轉換代碼，只是在圖像位進入pnm之前就對其進行了抓取。 您將在DCMTK中尋找的文件是dcm2pnm或可能是dcmj2pnm，具體取決於編碼方案。

我用運行時標志之一修復的縮放窗口有問題。 DCMTK是開源的，並帶有相當簡單的構建說明。

Answer 7

您正在使用純標准的 DICOM文件嗎？ 我一直在維護DICOM解析器兩年多了，但遇到了一些真正的奇怪DICOM文件，這些文件並沒有完全滿足標准（公司實現了“自己的”扭曲標准DICOM文件）。 將字節數組刷新到文件中，然后測試圖像查看器（irfanview，picassa或其他任何對象）是否可以顯示它。 如果您的代碼使用的是正常的JPEG流，那么根據我的經驗，有99.9999％的機會是因為文件以某種奇怪的方式破壞了標准（並且相信我，醫療公司做了很多事情）

另請注意，DICOM標准支持JPEG標准的多種變體。 可能是Bitmap類不支持您從DICOM文件獲取的數據。 您能寫下傳輸語法嗎？

歡迎您將文件發送給我（如果不大）yossi1981@gmail.com，我可以檢查一下，有一段時間我一直在對DICOM文件進行十六進制編輯。